L’utilisation de méthodes informatiques dans la conception pré-clinique de molécules thérapeutiques s’est développée à partir de 1970 dans le cadre d’une stratégie dite de « rational drug design ». Une analyse de cette approche est d’abord développée. Deux contextualisations de ces pratiques sont ensuite proposées. Certains résultats de l’historiographie des médicaments permettent, premièrement, de préciser la doctrine particulière du médicament à laquelle cette stratégie se rattache. Deuxièmement, puisque la rationalité déclarée de cette dernière s’appuie sur des outils scientifiques développés en (...) (bio)chimie, une analyse de leur statut épistémologique est conduite en étudiant leur émergence. Ceci permet de comprendre les spécificités que la rationalité véhiculée par ces outils computationnels comporte (représentation de la matière particulière dont la validité est uniquement pragmatique, emploi d’un grand nombre de données empiriques, réalisation d’estimations et approximations, diffusion de ces dernières sous forme de programmes informatiques). Nous soulignons l’importance de l’ordinateur dans la standardisation de ces méthodes. (shrink)