Une rétrospective des débats sur l'origine de la vie : le virus ou la cellule ? Le virus a besoin de la cellule pour se répliquer, mais la cellule est une forme plus évoluée à l'échelle évolutive de la vie. Les virus semblent avoir joué un rôle dans des événements tels que l'origine de la vie cellulaire et l'évolution des mammifères. Même la bactérie la plus simple est bien trop complexe pour être apparue spontanément au début de (...) l'évolution. Par la suite, l'évolution a pu produire des systèmes de plus en plus complexes. La première vraie cellule doit déjà avoir été un produit de l'évolution, résultant d'une communauté primordiale. DOI: 10.13140/RG.2.2.27284.53122. (shrink)

Anticiper les épidémies est le souhait le plus vif de toutes les institutions qui veillent sur la santé publique. Un raisonnement naïf permet de penser qu’il suffit de faire évoluer en laboratoire un organisme potentiellement pathogène pour savoir comment sa descendance pourra devenir plus virulente pour l’homme. Il est alors facile de faire croître cet organisme sur des cellules humaines, qu’il infecte mal pour commencer, puis de retenir ses descendants au fur et à mesure qu’ils deviennent plus infectieux. La vision (...) optimiste affirme alors que les caractériser permettra de construire des défenses appropriées. Bien des variations sur ce thème sont possibles, y compris avec l’aide de la synthèse artificielle de variants dont on saurait imaginer la pathogénicité pour l’homme. Depuis plus de deux décennies, des chercheurs développent des expériences de ce type, dite de « gain de fonction » (GdF). Leur interprétation repose sur l’illusion que nous savons prévoir l’évolution des êtres vivants. En réalité, ceux que nous observons aujourd’hui ont été sélectionnés au cours du temps précisément parce qu’ils conduisent toujours à des comportements imprévisibles. Une règle clé de l’évolution est que la vie, pour durer dans des circonstances qui ne peuvent être prévues, doit sans cesse faire émerger des formes innovantes. À ce caractère propre à la vie s’ajoute un imprévisible lié à l’impéritie humaine, cause de l’omniprésence des accidents de laboratoire. Or, en virologie spécialement, l’accident est la règle et non l’exception. Il faut ajouter que le caractère public de ces expériences les rend utilisables par toutes les structures malveillantes qui sont hélas répandues dans le monde. Il n’est pas difficile alors d’imaginer les conséquences catastrophiques des expériences de GdF. Nous proposons donc qu’elles soient purement et simplement interdites et que toute transgression soit sévèrement punie, en frappant d’abord au porte-monnaie, ce qui semble être la meilleure façon de faire dans nos sociétés devenues universellement vénales. (shrink)

Depuis les années 1980, le génie génétique a été largement utilisé pour modifier génétiquement des organismes et des aliments. La pratique des tests génétiques prénataux identifie des gènes ou des marqueurs génétiques indésirables. Les parents peuvent choisir de poursuivre leur grossesse ou d'abandonner le bébé. Une fois le diagnostic génétique préimplantatoire réalisé, les parents potentiels peuvent choisir de recourir à la fécondation in vitro, puis de tester les cellules embryonnaires précoces pour identifier les embryons avec les gènes qu’ils préfèrent, ou (...) éviter. DOI: 10.13140/RG.2.2.17948.03202 . (shrink)

Le papier commence par une rétrospective des débats sur l'origine de la vie : le virus ou la cellule ? Le virus a besoin de la cellule pour se répliquer, mais la cellule est une forme plus évoluée à l'échelle évolutive de la vie. De plus, l'étude des virus soulève des questions conceptuelles et philosophiques pressantes sur leur nature, leur classification et leur place dans le monde biologique. Le sujet des pandémies est abordé à partir de l'existentialisme (...) d'Albert Camus et Sartre, du remplacement du rituel d'exclusion par le mécanisme disciplinaire de Michel Foucault, et de l'hypothèse Gaia, développée par James Lovelock et soutenue dans la pandémie actuelle par Bruno Latour. Les dimensions sociales des pandémies, leur lien avec le réchauffement climatique, qui a conduit à une augmentation des maladies infectieuses, et la déforestation de vastes zones, qui ont provoqué la migration des virus de leur zone d'origine (leur « réservoir ») sont mis en évidence ci-dessous. L'éthique des pandémies est abordée sous plusieurs points de vue philosophiques, dont le plus important dans une crise de telles dimensions globales est l'utilitarisme qui consiste à maximiser les bénéfices pour la société en conflit direct avec la vision ordinaire (kantienne) du respect des personnes en tant qu'individus. Après une rétrospective du virus COVID-19 qui a causé la pandémie actuelle, son cycle de vie et son histoire, avec un accent sur la philosophie de la mort, est discuté le concept de biopouvoir initialement développé par Foucault, en référence à la pratique des États modernes de contrôle des populations, et le débat généré par Giorgio Agamben qui déclare que ce qui se manifeste dans cette pandémie est la tendance croissante des États à utiliser l'état d'urgence comme un paradigme normal de gouvernement. Une autre approche intéressante et très débattue est celle générée par les travaux de Slavoj Žižek, qui déclare que la pandémie actuelle a conduit à la faillite du capitalisme « barbare » actuel, se demandant si le chemin que l'humanité empruntera est un néocommunisme. Un autre effet négatif important est la désocialisation, avec la conclusion de certains philosophes que nous ne pouvons pas exister indépendamment de nos relations avec les autres, que l'humanité d'une personne dépend de l'humanité de ceux qui l'entourent. La dernière section est consacrée à prédire à quoi ressemblera le monde après la pandémie, et il y a déjà des signes de changement de paradigme, y compris la disparition soudaine de l'idéologie du « mur » : une toux a suffi à rendre soudain impossible d'échapper à la responsabilité qui chaque individu l'a envers tous les êtres vivants pour le simple fait qu'il fait partie de ce monde et du désir d'en faire partie. Le tout est toujours impliqué en partie, car tout est, en un sens, dans tout et dans la nature il n'y a pas de régions autonomes qui font exception. La pandémie COVID-19 semble restaurer la suprématie qui appartenait autrefois à la politique. L'une des vertus du virus est sa capacité à générer une idée plus sobre de la liberté : être libre signifie faire ce qui doit être fait dans une situation précise. -/- SOMMAIRE: -/- Abstract Introduction 1 Virus 1.1 Ontologie 2 Pandémies 2.1 Dimensions sociales 2.2 Ethique 3 COVID-19 3.1 Biopolitique 3.2 Néocommunisme 3.3 Désocialisation 4 Prévisions Bibliographie -/- DOI: 10.13140/RG.2.2.17905.92003 . (shrink)

[ENGLISH] This article discusses the potential of synthetic biology to address fundamental questions in the philosophy of biology regarding the nature of life and biological functions. Synthetic biology aims to reduce living organisms to their simplest forms by identifying the minimal components of a cell and also to create novel life forms through genetic reprogramming, biobrick assembly, or novel proteins. However, the technical success of these endeavors does not guarantee their conceptual success in defining life. There is a lack of (...) consensus among researchers on how to define and classify the entities produced in the lab, whether they should be considered living or categorized differently. The criteria for minimal cells and minimal life are subject to arbitrary choices and varying interpretations. The concept of function, crucial to synthetic biology, is also difficult to define. The article highlights the need to consider the minimal set of functions that characterize life before determining the smallest genomes that code for those functions. The arbitrary nature of defining both life and function complicates the understanding and classification of these entities. The article suggests that the traditional dichotomy between the living and the non-living may no longer be valid and that the concept of life itself may not require precise scientific definition. As synthetic biology advances, the article emphasizes the importance of redefining or constructing new categories to encompass the expanding possibilities and creations in the field. The ability to create new life forms raises questions about recognition, identification, and ethical implications, requiring a conceptual and philosophical engagement beyond the technical achievements of synthetic biology. -/- [FRENCH] L'article aborde le potentiel de la biologie synthétique pour répondre à des questions fondamentales de la philosophie de la biologie concernant la nature de la vie et des fonctions biologiques. La biologie synthétique vise à réduire les organismes vivants à leurs formes les plus simples en identifiant les composants minimaux d'une cellule et à créer de nouvelles formes de vie grâce à la reprogrammation génétique, à l'assemblage de biobriques ou à des protéines nouvelles. Cependant, le succès technique de ces approches ne garantit pas leur réussite conceptuelle dans la définition de la vie. Il n'y a pas de consensus parmi les chercheurs sur la façon de définir et de classer les entités produites en laboratoire, qu'elles doivent être considérées comme vivantes ou catégorisées différemment. Les critères des cellules minimales et de la vie minimale sont soumis à des choix arbitraires et à des interprétations variables. La notion de fonction, essentielle en biologie synthétique, est également difficile à définir. L'article met en évidence la nécessité de prendre en compte l'ensemble minimal de fonctions qui caractérisent la vie avant de déterminer les plus petits génomes qui codent ces fonctions. La nature arbitraire de la définition de la vie et de la fonction complique la compréhension et la classification de ces entités. L'article suggère que la dichotomie traditionnelle entre le vivant et le non-vivant pourrait ne plus être valable et que le concept même de vie ne nécessite pas une définition scientifique précise. À mesure que la biologie synthétique progresse, l'article souligne l'importance de redéfinir ou de construire de nouvelles catégories pour englober les possibilités et créations croissantes dans le domaine. La capacité à créer de nouvelles formes de vie soulève des questions de reconnaissance, d'identification et d'implications éthiques, nécessitant une réflexion conceptuelle et philosophique au-delà des avancées techniques de la biologie synthétique. (shrink)