The COVID-19 pandemic prompted immense work on the investigation of the SARS-CoV-2 virus. Rapid, accurate, and consistent interpretation of generated data is thereby of fundamental concern. Ontologies––structured, controlled, vocabularies––are designed to support consistency of interpretation, and thereby to prevent the development of data silos. This paper describes how ontologies are serving this purpose in the COVID-19 research domain, by following principles of the Open Biological and Biomedical Ontology (OBO) Foundry and by reusing existing ontologies such as the Infectious Disease Ontology (...) (IDO) Core, which provides terminological content common to investigations of all infectious diseases. We report here on the development of an IDO extension, the Virus Infectious Disease Ontology (VIDO), a reference ontology covering viral infectious diseases. We motivate term and definition choices, showcase reuse of terms from existing OBO ontologies, illustrate how ontological decisions were motivated by relevant life science research, and connect VIDO to the Coronavirus Infectious Disease Ontology (CIDO). We next use terms from these ontologies to annotate selections from life science research on SARS-CoV-2, highlighting how ontologies employing a common upper-level vocabulary may be seamlessly interwoven. Finally, we outline future work, including bacteria and fungus infectious disease reference ontologies currently under development, then cite uses of VIDO and CIDO in host-pathogen data analytics, electronic health record annotation, and ontology conflict-resolution projects. (shrink)

The COVID-19 pandemic prompted immense work on the investigation of the SARS-CoV-2 virus. Ontologies – structured, controlled, vocabularies – are designed to support consistency of interpretation, and thereby to prevent the development of data silos. This paper describes how ontologies are serving this purpose in the virus research domain, following the principles of the Open Biological and Biomedical Ontology (OBO) Foundry and drawing on the resources of the Infectious Disease Ontology (IDO) Core. We report the development of the Virus Infectious (...) Disease Ontology (VIDO), a reference ontology extending IDO Core covering viral infectious diseases. We examine newly minted terms, showcase ontology term reuse, and illustrate the use of VIDO by annotating selections from recent life science research on SAR-CoV-2, in the interest of supporting machine learning projects. (shrink)

The Infectious Disease Ontology (IDO) is a suite of interoperable ontology modules that aims to provide coverage of all aspects of the infectious disease domain, including biomedical research, clinical care, and public health. IDO Core is designed to be a disease and pathogen neutral ontology, covering just those types of entities and relations that are relevant to infectious diseases generally. IDO Core is then extended by a collection of ontology modules focusing on specific diseases and pathogens. In this paper we (...) present applications of IDO Core within various areas of infectious disease research, together with an overview of all IDO extension ontologies and the methodology on the basis of which they are built. We also survey recent developments involving IDO, including the creation of IDO Virus; the Coronaviruses Infectious Disease Ontology (CIDO); and an extension of CIDO focused on COVID-19 (IDO-CovID-19).We also discuss how these ontologies might assist in information-driven efforts to deal with the ongoing COVID-19 pandemic, to accelerate data discovery in the early stages of future pandemics, and to promote reproducibility of infectious disease research. (shrink)

This is the review of a book by Paula Byrne on Lord Mansfield's great-niece, Dido, whom he raised as his own daughter. Lord Mansfield was the Lord Chief Justice of England in the Eighteenth Century. The child was brought to him as an infant and grew up to become what we would today term his paralegal clerk in his Library at Kenwood House. His great-niece was the child of a black slave and his sister's son, Sir John Lindsay. (...) This is also a narrative of the British Slave trade including some of Lord Mansfield's judgements at the King's Bench Division, Royal Courts of Justice. (shrink)

UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DE PERNAMBUCO DEPARTAMENTO DE ZOOTECNIA – 50 ANOS EMANUEL ISAQUE CORDEIRO DA SILVA REPRODUÇÃO ANIMAL: OVULAÇÃO, CONTROLE E SINCRONIZAÇÃO -/- REPRODUÇÃO ANIMAL: OVULAÇÃO, CONTROLE E SINCRONIZAÇÃO DO CICLO ESTRAL -/- ANIMAL REPRODUCTION: OVULATION, CONTROL AND SYNCHRONIZATION OF THE ESTRAL CYCLE -/- Autor: Emanuel Isaque Cordeiro da Silva – IFPE-BJ/CAP-UFPE/EEFCC-BJ/UFRPE 1. INTRODUÇÃO As fêmeas dos animais domésticos possuem em seus ovários, desde praticamente o nascimento, a dotação completa de gametas dos quais vão dispor para o resto de sua (...) vida. No entanto, terão que esperar até a puberdade para que se produza a evolução completa dos folículos (foliculogênese) que darão como resultado as primeiras ovulações. Este momento caracteriza-se, por um lado, pelo início gradual da secreção por parte da hipófise de quantidades importantes de hormonas gonadotropinas (hormonas folículo estimulante «FSH» e sobretudo luteinizante «LH»); por outro lado, pelo aumento da capacidade dos seus ovários para responder a estas secreções. A partir daí, o aparelho reprodutor feminino das fêmeas domésticas deve apresentar, durante todo o período de atividade sexual, alterações morfológicas, endócrinas e fisiológicas, que devem ser repetidas sequencialmente e periodicamente, consoante com a duração e a frequência do ciclo estral característico de cada espécie animal, assegurando assim a liberação de um ou mais ovócitos férteis nos ciclos estrais correspondentes. -/- 2. EVOLUÇÃO DO OVÓCITO E DOS FOLÍCULOS OVÁRICOS O ovário constitui um órgão de armazenamento de ovócitos formados durante a vida fetal ou após o nascimento, os quais permanecerão «latentes», num estado de imaturidade, paralisando a sua atividade de desenvolvimento e crescimento após o processo de mitose pelo qual as células germinativas ou ovogonias evoluem para ovócitos primários. Estes ovócitos devem ser rodeados por células foliculares para alcançar sua maturação e posterior ovulação, constituindo-se, desta maneira, os folículos. Estes últimos, que se localizam no parênquima ovárico, sofrem uma série de mudanças evolutivas que os fazem passar de folículos primordiais (constituídos por um ovócito rodeado de células planas) a folículos maduros ou de Graaf, passando pelos estágios primário, secundário e terciários. A estrutura do ovário e a terminologia correspondente, bem como a sua fisiologia, já foram tratados em trabalhos anteriores. Basicamente, o folículo maduro ou de Graaf, que ressalta já na superfície ovariana como se tratasse de uma pequena vesícula cheia de líquido, encontra-se constituído, no caso dos mamíferos, pelas tecas externa e interna, a folha basal, o ovócito e o seu núcleo ou vesícula germinativa e um acúmulo de células da granulosa chamado cumulus. O antro-folicular ou cavidade intrafolicular formada durante o estágio de folículo terciário possui no seu interior um líquido cuja composição provém do plasma sanguíneo. Por outro lado, o ovócito, que desde a constituição da reserva de folículos primordiais se encontrava em estado de ovócito primário, começa a aumentar de volume (durante a fase de evolução do folículo terciário a folículo maduro) e a cobrir-se de uma membrana celular denominada zona pelúcida. Nos momentos que precedem imediatamente à ovulação reativa-se a meiose, liberando-se o primeiro corpúsculo polar e convertendo-se o ovócito em secundário. Produzida a ovulação retoma-se de novo a meiose, que tinha permanecido em repouso, e depois de ocorrer a fecundação libera-se o segundo corpúsculo polar, passando a ser uma ovotida ou óvulo maduro. -/- 3. A OVULAÇÃO Acabado o crescimento, o folículo maduro ou de Graaf é capaz de responder à descarga pré-ovulatória de gonadotropinas (LH e em menor medida FSH) de tal forma que se produza uma reestruturação completa do mesmo e a subsequente liberação de um ovócito fértil através de um pequeno orifício (estigma) produzido no ponto de ruptura da sua parede celular e das camadas celulares mais superficiais do córtex ovárico, cuja espessura, neste momento, é muito reduzida. No momento da ovulação tanto o líquido folicular como o ovócito são projetados, entre outras causas, pela contração da musculatura lisa que rodeia os folículos para a cavidade peritoneal caindo perto das fimbrias do oviduto ou trompas de Falópio. Esta expulsão, no caso das vacas e ovelhas, ocorre sob a forma de um fluxo fluido, enquanto na coelha ocorre sob a forma de um jato súbito ou de um processo explosivo. No caso da égua, a estrutura dos seus ovários difere das outras fêmeas domésticas, no sentido em que a zona vascular se localiza superficialmente e os folículos se distribuem no interior do ovário. Ao mesmo tempo, a ovulação ocorre unicamente num determinado ponto denominado fossa de ovulação. Por tudo isso, durante a foliculogênese, os folículos vão migrando para a fossa de ovulação, chegando em algumas ocasiões a ficarem presos no interior do ovário, não conseguindo desenvolver-se nem evolucionar (folículo cístico) e que, ao apresentar uma secreção contínua de estrogênios, produz na fêmea um estado de cio permanente ou ninfomania. Nas espécies cuja ovulação é espontânea, o processo supra ocorre periódica e sequencialmente em todos os ciclos estrais com um intervalo conhecido a partir do início do estro ou, no caso da vaca, após o término deste (tabela 1). Por outro lado, nas espécies de ovulação induzida (coelha, gata e fêmeas de furão e camelo) esta ocorre pouco depois de realizado o coito. Nestas espécies, o estímulo coital, favorecido pelas espículas localizadas no pênis do macho, determina por via eferente nervosa a liberação hipotalâmica de GnRH, que em poucos minutos depois provoca a secreção adeno-hepática de LH, que por via sistêmica alcança os folículos, desencadeando os processos fisiológicos que conduzem à ovulação. Tabela 1: Parâmetros que definem o ciclo sexual e tipo de ovulação de algumas espécies domésticas (adaptado e elaborado a partir de DUKES, et. al. 1996). -/- Espécie Duração do ciclo estral Atividade sexual Tipo de ovulação E/I N° de ovócitos Duração do estro Momento da ovulação Vaca 21 dias Poliéstrica contínua E 1 18 horas 11 horas após o final do estro Ovelha 17 dias Poliéstrica estacional E 1-3 29 horas Ao final do estro Porca 21 dias Poliéstrica contínua E 11-24 45 horas 24-36 horas do começo do estro Égua 21 dias Poliéstrica estacional E 1 6 dias 24-48 horas antes do final do cio Cabra 20 dias Poliéstrica estacional E 1-3 40 horas 33 horas do começo do estro Cadela 9 dias Monoéstrica a cada 4-8 E — 7-9 dias 3-4 dias do começo do estro Gata 5 dias Poliéstrica estacional I 3-4 4 dias 27 horas postcoito Coelha 16 dias Poliéstrica I 4-12 Não definida 10 horas postcoito -/- Dado que a vida fértil dos ovócitos, uma vez produzida a ovulação, raramente ultrapassa as 10-12 horas, é importante, sobretudo quando se realiza inseminação artificial ou monta dirigida, determinar, a partir da presença dos sintomas de cio, o período de tempo durante o qual a fertilização numa exploração específica será efetuada, evitando-se assim uma redução da fecundidade. 3.1 Ovulação simples e múltipla Em algumas ocasiões, dependendo da espécie (ver tab. 1), são vários os folículos que apresentam uma evolução completa, chegando a possuir nas células da granulosa receptores de LH, com o qual realiza-se a descarga ovulante de gonadotropinas e produz-se uma ovulação múltipla ou multiovulação, sendo, neste caso, libertados vários ovócitos férteis. No esquema abaixo, observa-se os processos de recrutamento, seleção e dominação da espécie ovina, a partir dos quais um ou vários folículos em crescimento chegam a ovular, bem como a influência das gonadotropinas FSH e LH em cada uma destas fases. Independentemente da influência genética, manifestada pelas diferenças entre espécies, raças e mesmo estirpes, os processos que determinam que entre um grupo de folículos em crescimento sejam um ou vários deles que cheguem a ovular englobam-se sob os termos de recrutamento, seleção e dominação folicular (fig. 1). -/- Figura 1. Recrutamento, seleção e dominação folicular na espécie ovina e influência do FSH e LH nas fases. SILVA, 2019. O recrutamento é definido como a entrada em crescimento terminal de um grupo de folículos gonadodependentes, ou seja, que dentre os folículos em crescimento que existem no reservatório ovariano iniciarão seu crescimento terminal aqueles que possuem receptores à FSH (a partir do estágio primário já os possuem) e tenham igualmente atingido um tamanho determinado, que varia entre as diferentes espécies (2 mm Ø em ovelhas). Geralmente o número de folículos recrutados é duas ou três vezes superior ao número de folículos ovulados. O recrutamento no caso da ovelha ocorre três dias antes da ovulação sob a regressão do corpo lúteo e aumento de FSH. A seleção é caracterizada porque entre os folículos recrutados um ou vários folículos continuam a aumentar de tamanho, enquanto o resto se torna atrésico. No caso da ovelha, o tamanho do folículo no momento da seleção corresponde ao tamanho em que aparecem os receptores de LH sobre a granulosa (folículo terciário) ou quando, como se verá posteriormente, a aromatização de andrógenos em estrogênios é máxima. Por outro lado, a produção de inibina (hormônio gonodal não esteroide) é igualmente elevada. A interação destes dois fatores de retroalimentação (estrogénios e inibina) para a secreção de FSH provoca uma redução dos níveis desta hormona, facilitando a seleção: neste contexto, verificou-se que a injeção de FSH em ovinos bloqueia a seleção produzindo, com efeito, uma multiovulação. No caso da vaca, poderia existir um segundo mecanismo regulador: o folículo maior poderia secretar, em um momento da seleção, um composto de ação parácrina, diminuindo a resposta de outros folículos à ação dos níveis existentes de FSH. A dominância que produz os folículos selecionados está associada com a regressão ou atresia de outros folículos recrutados e com a inibição do recrutamento de novos folículos. Embora os níveis de FSH diminuam, os folículos dominantes persistem porque reduzem suas necessidades em FSH. Esta adaptação a meios mais pobres em FSH poderia explicar-se, entre outras causas, pela ampliação da resposta a esses níveis baixos em FSH graças à produção de IGFI (Insulin Like Growth Factor l), no caso da ovelha, pelo folículo dominante. O IGFI estimula a aromatização dos androgênios em estrogênios e, por sua vez, o estradiol estimula a produção de IGFI nas células granulosas, tornando-a ao mesmo tempo mais sensível ao IGFI. Este laço formado pelo estradiol e IGFI pode desempenhar um papel importante na produção do folículo dominante do estradiol. -/- 4. MECANISMOS NEUROENDÓCRINOS QUE CONDUZEM À OVULAÇÃO A ovulação, propriamente dita, pode ser um bom ponto de partida para explicar os mecanismos neuroendócrinos que se sucedem para alcançar, no próximo ciclo estral, uma nova ovulação. Imediatamente após a ocorrência da ovulação, forma-se um coágulo de sangue no interior do folículo em consequência da hemorragia causada pela ruptura celular (folículo hemorrágico) e que servirá de substrato para o crescimento das células granulosas. Em seguida, as células da granulosa hipertrofiam e proliferam rapidamente, acumulando lipídios e pigmentos carotenoides (luteína) que lhe conferem uma cor amarelada (corpo lúteo). Esta estrutura formada, sob a ação do LH e também da prolactina, começa a produzir progesterona, a qual além de preparar o aparelho reprodutor para uma possível gestação inibe, a nível da hipófise, a secreção cíclica de LH, impedindo assim novas ovulações. À medida que os níveis de progesterona diminuem devido à regressão do corpo lúteo sob a ação da PGF2a (prostaglandina 2a), vários folículos começam seu crescimento sob a ação dos níveis de FSH (cada vez maiores), atingindo o seu crescimento final na fase folicular. Alcançado o estado de terciário, as células da teca interna do folículo, estimuladas pela secreção tônica do LH liberada pela hipófise em pequenas ondas (sem chegar a atingir a quantidade que provoca a ovulação), sintetizam a partir do colesterol, passando por alguns passos intermediários, testosterona, que é depois aromatizada a estradiol sob a ação do FSH pelas células da granulosa (fig. 2). A prolactina, juntamente com o FSH, também influencia o crescimento e a maturação dos folículos, bem como a produção de estrogênios. À medida que avança o crescimento e maturação dos folículos, a concentração de estradiol aumenta (os folículos que em um momento da evolução se tornam atrésicos aportam também uma quantidade importante de estradiol), sendo máxima nos momentos imediatos à ovulação (fig. 3). Este aumento, sustentado na taxa circulante de estrogênios, é a responsável pelo aparecimento do cio nas fêmeas, cujo final, geralmente, exerce um efeito feedback positivo sobre o eixo hipotálamo-hipofisário induzindo o pico pré-ovulatório de LH (e também FSH), que conduz a nova ovulação. Figura 2. Processo de aromatização dos andrógenos em estrógenos. (Adaptado e elaborado a partir de ILLERA, 1994). -/- Figura 3. Crescimento prático folicular, e níveis de progesterona e 17 estradiol (a) e FSH e LH (b), durante o ciclo estral da ovelha. (Elaborado a partir de DURÁN DEL CAMPO, 1980). Nota importante: a ovulação em algumas espécies não é acompanhada do cio (ovulações silentes ou silenciosas), sobretudo nas primeiras ovulações da puberdade e após o anestro estacionário, devido a produção nula da estimulação prévia da progesterona. Embora citado anteriormente que o crescimento folicular começa no final da fase lútea no caso da vaca, a ovelha e a égua, a população de folículos ovulatórios se renova ao longo do ciclo estral, produzindo-se um crescimento e regressão dos folículos, denominado onda folicular. Nestas ondas, que também podem ocorrer durante o período pré-púbere, anestro estacionário e pós-parto, os folículos são receptores à descarga de LH, no entanto, a sua capacidade de produzir estradiol é muito limitada devido a uma deficiência de precursores em tecas ou a uma inadequação da aromatização dos androgênios em estrogênios, com o qual não se atinge a quantidade de estrogênios necessários para produzir a ativação nervosa necessária para a liberação cíclica de LH. Do ponto de vista prático, o conhecimento dos mecanismos neuroendócrinos que se sucedem durante o ciclo estral e que conduzem à ovulação, bem como a sua possível regulação mediante técnicas culturais ou tratamentos hormonais, é de vital importância quando o que se pretende é realizar um controle e sincronização tanto do cio quanto da ovulação. -/- 5. ALTERAÇÕES MORFOLÓGICAS ASSOCIADAS À OVULAÇÃO Nos momentos prévios à ovulação, o folículo ovulatório experimenta uma série de mudanças morfológicas e histológicas regulamentadas endocrinamente e cuja finalidade será a modificação da estrutura do folículo, facilitando a liberação do ovócito fértil. Logo após a descarga pré-ovulatória, ocorre um aumento do fluxo sanguíneo associado a um acúmulo de sangue que dependerá, entre outros, da prostaglandina E2 (PGF2) secretada pelas células granulosas. A teca externa é edemaciada pela difusão do plasma sanguíneo e o volume do antro folicular aumenta pela atração de água exercida pelo ácido hialurônico secretado pelas células do cumulus sob a ação do FSH/LH. Este aumento de volume é facilitado pela dissociação dos feixes de fibras de colágeno da teca externa e da túnica albugínea sob a ação de duas enzimas: a colagenase e a plasmina. A plasmina age em primeiro lugar e aparece como resultado da produção de ativadores do plasminogênio pelas células da granulosa e do cumulus; sua atividade é máxima no ápice do folículo dissociando a matriz proteica dos feixes de fibras de colágeno e ativando o precursor da colagenase. Além disso, a atividade da colagenase é máxima no momento da ruptura do folículo. A maioria das células da granulosa que estão fixadas na lâmina basal se soltam, perdem sua união em colônia e deixam de se dividir (fig. 4). As ligações que as ligavam desaparecem, mas a sua dissociação não é completa devido, provavelmente, à produção local de inibidores da colagenase. As células do cumulus sofrem as mesmas transformações, mas a sua dissociação é total porque estas secretam ácido hialurônico. No entanto, as células que asseguraram, desde o início do crescimento folicular, a ligação entre a granulosa e o ovócito permanecem durante um período mais ou menos longo, ligadas à coroa radiada. Figura 4. Estado de um folículo pouco antes da ovulação. DRIANCOURT, et al. 1991. Pouco antes da ovulação, a lâmina basal desaparece de seu lugar, ocorre uma individualização dos vasos sanguíneos e as células da teca interna penetram no folículo. No ápice do folículo, produz-se uma deficiência na irrigação sanguínea e, portanto, de oxigênio, o que faz com que as células do epitélio ovariano morram. As hidrolases, que nesse momento são liberadas, contribuem para a destruição completa dos tecidos subjacentes. Em definitivo, é o conjunto de fatos comentado supra que conduzem à ruptura do ápice do folículo e provocam um aumento da pressão hidrostática que se traduz em uma contração do folículo expulsando o ovócito e as células da coroa radiada. -/- 6. CONTROLE, SINCRONIZAÇÃO E INDUÇÃO DA OVULAÇÃO 6.1 Introdução O controle e a sincronização da ovulação se situa dentro de um contexto muito mais amplo como é o controle da reprodução, entendendo como tal o governo dos elementos manipuláveis do processo reprodutivo. No âmbito do controle da reprodução, existem muitos objetivos, entre os quais a indução da puberdade, a cobertura em época de anestro, aumento da prolificidade, entre outras. Além disso, o controle da reprodução é necessário para a utilização de determinadas técnicas, como a inseminação artificial ou a transferência de embriões. Com efeito, e consoante com o objetivo pretendido, poderão ser utilizadas diferentes técnicas e métodos, tais como os tratamentos hormonais, o efeito macho, a alimentação (Flushing) e os cruzamentos, tudo isso, por sua vez, empregado nos esquemas de seleção. Neste sentido e como passo prévio à sincronização e indução da ovulação, em muitas ocasiões se realiza também um controle e sincronização do cio. Este último, além de permitir que o criador regule o momento do estro e da cobrição, podendo em algumas espécies suprimir o anestro estacionário, permite que os animais se agrupem em lotes homogêneos e assim poder alimentá-los com as dietas adequadas segundo o estado de gestação, atender os partos e assim diminuir a mortalidade neonatal, programar os desmames e engordar os animais para, por fim, vender os animais por lotes. Na sincronização do cio o que se pretende é atuar sobre o intervalo entre a fase folicular e a fase luteica, modificando, portanto, a duração do ciclo estral (fig. 5). Figura 5. Representação dos métodos de sincronização do ciclo estral: (a) duração normal das fases luteica e folicular: (b) fase luteica cortada: (c) extensão da fase luteica. HUNTER, 1987. Para alcançar esse objetivo, os criadores podem adotar dois métodos: a) Induzindo a regressão do corpo lúteo de um grupo de animais de forma que todos eles iniciem a fase folicular e apresentem o cio num espaço de tempo bastante semelhante (injeções de prostaglandinas) (fig. 5b). b) Alargando artificialmente, através de um bloqueio hormonal, a fase luteica de tal modo que, ao cessar esse bloqueio e injetar-lhes gonadotropinas exógenas, os animais iniciem conjuntamente uma fase folicular seguida de um cio sincronizado (injeções de progesterona, implantes de progesterona ou progestágenos, esponjas vaginais impregnadas de progestágenos) (fig. 5c). 6.2 Objetivos e fundamentos Os tratamentos de controle e sincronização da ovulação têm por objetivo tentar regular, por um lado, o momento exato da ovulação, e por outro, o número de folículos que possam chegar a liberar ovócitos férteis, ao qual pode-se conseguir mediante a intervenção nos processos de recrutamento e seleção dos folículos. O primeiro objetivo permitirá que se realize a inseminação artificial no momento propício, evitando o envelhecimento dos ovócitos e que se possa calcular o momento da fertilização e a fase de desenvolvimento dos embriões (realização de transplantes). Por outro lado, o segundo objetivo ajudará a aumentar a fertilidade e a prolificidade em um rebanho e, no caso de fêmeas doadoras para a transferência de embriões, a relação: número de embriões/fêmea doadora. A indução da ovulação e/ou o aumento da taxa de ovulação pode ser conseguida aumentando os níveis de gonadotropinas no sangue antes do início da atresia folicular, ou seja, 3 a 5 dias antes da ovulação. Por outro lado, a taxa de ovulação pode também ser aumentada através da imunização contra esteroides, embora, por outro lado, permitam uma sincronização de cios. Além disso, o aumento dos níveis de gonadotropinas pode ser conseguido estimulando a sua secreção pelo próprio organismo do animal, por injeção de fatores de liberação hipotalâmicos que estimulem na hipófise a secreção de gonadotropinas, através do manejo dos reprodutores (efeito macho) e da alimentação (Flushing) ou por injeção das gonadotropinas no animal. 6.3 Imunização contra esteroides A imunização contra esteroides é uma técnica eficaz para aumentar a taxa de ovulação de animais que encontram-se em atividade sexual, ou seja, fora do anestro, uma vez que o seu mecanismo de ação baseia-se na alteração do controle endócrino da ovulação devido à ação dos anticorpos contra os esteroides ováricos, especialmente contra a androstenediona. Esta última regula a produção de uma proteína denominada «interleucina l», secretada pelos macrófagos do sistema imunitário e que inibe a diferenciação dos receptores à LH nos folículos, sem afetar a quantidade de sangue do FSH. Por isso, a teoria que tenta explicar o mecanismo de ação dos tratamentos de imunização é a seguinte: «O bloqueio dos esteroides pelos anticorpos do tratamento reduziria a produção de «interleucina l», permitindo assim que um maior número de folículos tivessem receptores à LH e pudessem ovular». Existem dois tipos de imunização: imunização ativa e imunização passiva. Na primeira, a metodologia consiste em tratar o animal com uma série de vacinas por via subcutânea ou intradérmica, pelo menos em duas ocasiões, até que a resposta imunitária atinja o nível desejado e ele próprio produza os anticorpos contra o antígeno (androstenediona) contido no conteúdo da vacina. Por outro lado, na imunização passiva o animal tratado recebe soro, por via intravenosa, de outro animal que foi imunizado (anticorpos policlonais), ou anticorpos monoclonais produzidos mediante técnicas imunológicas modernas. 6.4. Injeções de hormonas gonadotropinas As preparações hormonais de gonadotropinas injetadas num momento adequado do ciclo estral permitem, por um lado, aumentar o número de folículos em desenvolvimento (preparações ricas em atividade FSH) e, por outro lado, controlar e sincronizar o momento da ovulação (preparações ricas em atividade LH). Atualmente, os preparados hormonais à base de LH e FSH puros obtidos a partir de glândulas pituitárias em matadouros deixaram de ser utilizados, já que, além de não serem economicamente rentáveis, a sua conservação e utilização acarreta inúmeros problemas. a) A PMSG ou gonadotropina do soro de égua gestante com atividade predominante em FSH. Este hormônio, que permite aumentar o número de folículos em desenvolvimento, deve ser injetado (em doses variáveis segundo a espécie; tabela 2) no início da fase folicular, imediatamente após a regressão do corpo lúteo, quando as gonadotropinas endógenas do próprio animal estimulam o crescimento folicular. Para determinar esse exato momento, normalmente se realiza uma sincronização do cio. Tabela 2. Doses de aplicação do PMSG e do HCG (em unidades internacionais SI) para regular a quantidade e o momento da ovulação Espécie PMSG HCG Vaca 2000 - 3000 500 - 2500 Ovelha 500 - 800 250 - 500 Porca 750 - 1500 500 - 1000 Adaptado e elaborado a partir de HUNTER, 1987. b) A HCG ou gonadotropina coriónica humana com atividade predominante em LH. Pode ser obtida facilmente, já que se acumula na urina da mulher gestante, servindo sua detecção como teste para a determinação da gestação (teste da rã: origina a ejaculação na rã macho). Uma vez que com esta hormona se pretende controlar o momento da ovulação, a injeção deve ser feita por via intravenosa ou intramuscular, algumas horas antes do animal ter iniciado o estro e portanto a liberação das hormonas gonadotropinas. Pode-se conseguir mediante a injeção, com um intervalo conhecido e em doses adequadas (2), após estimulação com PMSG ou após sincronização do estro. 6.5 Limites das técnicas de controle, sincronização e indução à ovulação Os objetivos almejados durante o tratamento de sincronização e indução da ovulação, acima mencionados, não chegaram a ser alcançados em sua totalidade devido, principalmente, aos seguintes fatores: a) O hipotálamo mediante a liberação em forma de ondas ou pulsações cada um ou dois minutos de fatores liberadores (GnRH) estimula a hipófise para a secreção de hormônios gonadotropinas, o que na prática é muito difícil de se artificializar. b) Como resultado das injeções de hormonas gonadotropas produz-se um feedback dos esteroides gonodais, o qual interfere na secreção de hormonas endógenas e na precisão da resposta. c) As preparações hormonais de natureza proteica provocam a formação de anticorpos no animal, pelo qual a relação dose-resposta não é exata. d) Uma vez que os níveis de resposta tenham sido atingidos, a administração de doses excessivas de gonadotropinas produz uma redução do número de ovulações e interfere nos mecanismos ovulatórios. -/- 7. RESUMO E PRIMEIRAS CONCLUSÕES A ovulação marca o culminar de uma série de alterações morfológicas, fisiológicas e endócrinas que se sucedem no aparelho reprodutor feminino e mais concretamente no ovário e nos folículos ováricos e cujo objetivo é a liberação, após a descarga ovulante de LH, de um ou mais ovócitos férteis, de acordo com as espécies. Da mesma forma, a ovulação se caracteriza pela retomada da meiose e a liberação do primeiro corpúsculo polar, bem como a iniciação da luteinização das células da granulosa e a reestruturação da parede do folículo. Isto ocorre tanto em espécies de ovulação espontânea como induzida. Todas estas alterações são condicionadas pela variação da concentração sanguínea das hormonas gonadotropinas devido ao feedback positivo ou negativo que os esteroides ováricos exercem sobre o hipotálamo em cada uma das fases do ciclo estral. Por este motivo, se num momento preciso do ciclo estral estimula-se a secreção, por parte da hipófise, de hormonas gonadotropinas mediante a injeção de fatores de liberação hipotalâmicos (GnRH) ou a aplicação de algumas técnicas de manejo (efeito macho e Flushing) ou mediante a incrementação da sua concentração no sangue através de injeções de preparações hormonais, será obtido um controle, sincronização e indução da ovulação. Os diferentes tratamentos de sincronização e indução da ovulação, embora apresentem algumas limitações, permitem regular o momento da ovulação e o número de folículos que chegarão a ovular, alcançando em alguns casos uma superovulação, objetivo pretendido na técnica de transplante de embriões. -/- 8. REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS -/- BARUSELLI, Pietro Sampaio; GIMENES, Lindsay Unno; SALES, José Nélio de Sousa. Fisiologia reprodutiva de fêmeas taurinas e zebuínas. Revista Brasileira de Reprodução Animal, v. 31, n. 2, p. 205-211, 2007. -/- BINELLI, Mario; IBIAPINA, Bruna Trentinaro; BISINOTTO, Rafael Siscôneto. Bases fisiológicas, farmacológicas e endócrinas dos tratamentos de sincronização do crescimento folicular e da ovulação. Acta Scientiae Veterinariae, v. 34, n. Supl 1, p. 1-7, 2006.p -/- BRACKETT, B. G.; JÚNIOR, G. E. A.; SEIDEL, S. M. Avances en zootecnia. Nuevas técnicas de reproducción animal. 1ª ed. Zaragoza: Editorial Acribia, 1988. -/- COLE, H. H.; CUPPS, P. T. Reproduction in domestic animals. 1ª ed. Londres: Academic Press, 1977. -/- CORTEZ, A. A.; TONIOLLI, R. Aspectos fisiológicos e hormonais da foliculogênese e ovulação em suínos. Revista Brasileira de Reprodução Animal, v. 36, p. 163-173, 2012. -/- CUNNINGHAM, James. Tratado de fisiologia veterinária. Elsevier Health Sciences, 2011. -/- DA SILVA, Emanuel Isaque Cordeiro. Características Gerais dos Bovinos/General Characteristics of Cattle Bovine. Disponível em: philpeople. Acesso em: Fevereiro de 2020. -/- DERUSSI, A. A. P.; LOPES, M. D. Fisiologia da ovulação, da fertilização e do desenvolvimento embrionário inicial na cadela. Revista Brasileira de Reprodução Animal, v. 33, n. 4, p. 231-237, 2009. -/- DRIANCOURT, M. A. et al. The ovarian function. Paris: INRA, 1991. -/- DUKES, Henry Hugh; SWENSON, Melvin J.; REECE, William O. Dukes fisiologia dos animais domésticos. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 1996. -/- DURÁN DEL CAMPO, A. Anatomia, fisiologia de la reproduccion e inseminación artificial en ovinos. Montevideo, Editorial Hemisferio Sur, 1980. 245p. -/- HAFEZ, E. S. E.; HAFEZ, B. Reprodução animal. São Paulo: Manole, 2004. -/- HUNTER, R. H. F. Reproducción de los animales de granja. Zaragoza: Acribia, 1987. -/- ILLERA, M. Endocrinología Veterinaria y Fisiología de la Reproducción. Zaragoza: Fareso, 1994. -/- MARTIN, Ian; FERREIRA, João Carlos Pinheiro. Fisiologia da ovulação e da formação do corpo lúteo bovino. Veterinária e Zootecnia, v. 16, n. 2, p. 270-279, 2009. -/- RASWEILER IV, John J.; BADWAIK, Nilima K. Anatomy and physiology of the female reproductive tract. In: Reproductive biology of bats. Academic Press, 2000. p. 157-219. (shrink)

The Cell Ontology (CL) is designed to provide a standardized representation of cell types for data annotation. Currently, the CL employs multiple is_a relations, defining cell types in terms of histological, functional, and lineage properties, and the majority of definitions are written with sufficient generality to hold across multiple species. This approach limits the CL’s utility for cross-species data integration. To address this problem, we developed a method for the ontological representation of cells and applied this method to develop a (...) dendritic cell ontology (DC-CL). DC-CL subtypes are delineated on the basis of surface protein expression, systematically including both species-general and species-specific types and optimizing DC-CL for the analysis of flow cytometry data. This approach brings benefits in the form of increased accuracy, support for reasoning, and interoperability with other ontology resources. 104. Barry Smith, “Toward a Realistic Science of Environments”, Ecological Psychology, 2009, 21 (2), April-June, 121-130. Abstract: The perceptual psychologist J. J. Gibson embraces a radically externalistic view of mind and action. We have, for Gibson, not a Cartesian mind or soul, with its interior theater of contents and the consequent problem of explaining how this mind or soul and its psychological environment can succeed in grasping physical objects external to itself. Rather, we have a perceiving, acting organism, whose perceptions and actions are always already tuned to the parts and moments, the things and surfaces, of its external environment. We describe how on this basis Gibson sought to develop a realist science of environments which will be ‘consistent with physics, mechanics, optics, acoustics, and chemistry’. (shrink)

We present Backward Clock, an original counterexample to Robert Nozick’s truth-tracking analysis of propositional knowledge, which works differently from other putative counterexamples and avoids objections to which they are vulnerable. We then argue that four ways of analysing knowledge in terms of safety, including Duncan Pritchard’s, cannot withstand Backward Clock either.

As he moves closer to half of his term as president of the Philippines, Rodrigo Roa Duterte has continually been in friction with the Catholic Church, specifically with certain members of its hierarchy. Mainly identifiable as the dividing line between Duterte’s administration and the Church is the issue on human rights particularly the extrajudicial killings (EJK) of suspected users and pushers of illegal drugs. This paper argues that Duterte’s attitude and positioning towards the Catholic Church neither strengthen nor advance the (...) Philippine state towards a greater degree of secularization. On the contrary, the Church has become more politically and publicly involved. Consequently, it has remained a key actor or interest group providing an alternative moral discourse to that of the government. (shrink)

The A-theory and the B-theory advance competing claims about how time is grounded. The A-theory says that A-facts are more fundamental in grounding time than are B-facts, and the B-theory says the reverse. We argue that whichever theory is true of the actual world is also true of all possible worlds containing time. We do this by arguing that time is uniquely groundable: however time is actually grounded, it is necessarily grounded in that way. It follows that if either the (...) A-theory or the B-theory is actually false, then it is necessarily false. (shrink)

Richard Peters argued for a general education based largely on the study of truth-seeking subjects for its own sake. His arguments have long been acknowledged as problematic. There are also difficulties with Paul Hirst's arguments for a liberal education, which in part overlap with Peters'. Where justification fails, can historical explanation illuminate? Peters was influenced by the prevailing idea that a secondary education should be based on traditional, largely knowledge-orientated subjects, pursued for intrinsic as well as practical ends. Does history (...) reveal good reasons for this view? The view itself has roots going back to the 16th century and the educational tradition of radical Protestantism. Religious arguments to do with restoring the image of an omniscient God in man made good sense, within their own terms, of an encyclopaedic approach to education. As these faded in prominence after 1800, old curricular patterns persisted in the drive for ‘middle-class schools’, and new, less plausible justifications grew in salience. These were based first on faculty psychology and later on the psychology of individual differences. The essay relates the views of Peters and Hirst to these historical arguments, asking how far their writings show traces of the religious argument mentioned, and how their views on education and the development of mind relate to the psychological arguments. (shrink)

Time in electromagnetism shares many features with time in other physical theories. But there is one aspect of electromagnetism's relationship with time that has always been controversial, yet has not always attracted the limelight it deserves: the electromagnetic arrow of time. Beginning with a re-analysis of a famous argument between Ritz and Einstein over the origins of the radiation arrow, this chapter frames the debate between modern Einsteinians and neo-Ritzians. It tries to find a clean statement of what the arrow (...) is and then explains how it relates to the cosmological and thermodynamic arrows, representing the most developed and sophisticated attack yet, in either the physics or philosophy literature, on the electromagnetic arrow of time. (shrink)

The “shrinking” of the globe in the last few centuries has made explicit that the world is a tense unity of many: the many worlds are forced to contend with one another. Nishida Kitarō, the founder of the Kyoto school, once stated that to be is to be implaced. We exist by partaking in “the socio-historical world.” More recently, Jean-luc Nancy has conceived of the world in terms of sense. What is striking in both is that the world emerges out (...) of a nothing, created ex nihilo—the phrase stripped of its theistic connotations. While for Nishida the world is ultimately implaced in the “place of absolute nothing,” Nancy speaks of the nothing that is the basis of the world’s self-creation. I will explore a possible convergence between these and any light it may shed upon our contemporary situation of globalization and its implications for praxis. I look to a sense of the nothing as a chōratic spatiality, an opening that provides space for co-being and serves as the source of creativity. In face of globalization, the project for meaning through mondialisation (in Nancy) and within a multi-cultural world (in Nishida) would imply the appropriation of such an originary spatiality. (shrink)

This paper seeks to answer the question: Can contemporary forms of artificial intelligence be creative? To answer this question, I consider three conditions that are commonly taken to be necessary for creativity. These are novelty, value, and agency. I argue that while contemporary AI models may have a claim to novelty and value, they cannot satisfy the kind of agency condition required for creativity. From this discussion, a new condition for creativity emerges. Creativity requires curiosity, a motivation to pursue epistemic (...) goods. I argue that contemporary AI models do not satisfy this new condition. Because they lack both agency and curiosity, it is a mistake to attribute the same sort of creativity to AI that we prize in humans. Finally, I consider the question of whether these AI models stand to make human creativity in the arts and sciences obsolete, despite not being creative themselves. I argue, optimistically, that this is unlikely. (shrink)

In Plato’s Philebus, Socrates’ second account of ‘false’ pleasure (41d-42c) outlines a form of illusion: pleasures that appear greater than they are. I argue that these pleasures are perceptual misrepresentations. I then show that they are the grounds for a methodological critique of hedonism. Socrates identifies hedonism as a judgment about the value of pleasure based on a perceptual misrepresentation of size, witnessed paradigmatically in the ‘greatest pleasures’.

I argue for an account of creativity that unifies creative achievements in the arts, sciences, and other domains and identifies its characteristic value. This account draws upon case studies of creative work in both the arts and sciences to identify creativity as a kind of successful exploration. I argue that if creativity is properly understood in this way, then it is fundamentally a property of processes, something only agents can achieve, something that comes in degrees, subjectively novel, and non-formulaic. As (...) I develop the account, I show how it avoids challenges faced by other accounts of creativity, especially concerning creativity’s value. Hills and Bird (2018, 2019) have together argued that creativity is not necessarily valuable. My account challenges this view. If I am right that creativity is a kind of successful exploration, then creativity does have a characteristic value, specifically epistemic value. (shrink)

This paper seeks to identify the distinctive moral wrong of stalking and argues that this wrong is serious enough to criminalize. We draw on psychological literature about stalking, distinguishing types of stalkers, their pathologies, and victims. The victimology is the basis for claims about what is wrong with stalking. Close attention to the experiences of victims often reveals an obsessive preoccupation with the stalker and what he will do next. The kind of harm this does is best understood in relation (...) to the value of privacy and conventionally protected zones of privacy. We compare anti-stalking laws in different jurisdictions, claiming that they all fail in some way to capture the distinctive privacy violation that stalking involves. Further reflection on the seriousness of the invasion of privacy it represents suggests that it is a deeply personal wrong. Indeed, it is usually more serious than obtrusive surveillance by states, precisely because it is more personal. Where state surveillance genuinely is as intrusive as stalking, it tends to adopt the tactics of the stalker, imposing its presence on the activist victim at every turn. Power dynamics —whether rooted in the power of the state or the violence of a stalker —may exacerbate violations of privacy, but the wrong is distinct from violence, threats of violence and other aggression. Nor is stalking a simple expression of a difference in power between stalker and victim, such as a difference due to gender. (shrink)

In a recent very interesting and important challenge to tracking theories of knowledge, Williams & Sinhababu claim to have devised a counter-example to tracking theories of knowledge of a sort that escapes the defense of those theories by Adams & Clarke. In this paper we will explain why this is not true. Tracking theories are not undermined by the example of the backward clock, as interesting as the case is.

A revisionist account of how philosophical induction was conceived in the ancient world and how that conception was transmitted, altered, and then rediscovered. I show how philosophers of late antiquity and then the medieval period came step-by-step to seriously misunderstand Aristotle’s view of induction and how that mistake was reversed by humanists in the Renaissance and then especially by Francis Bacon. I show, naturally enough then, that in early modern science, Baconians were Aristotelians and Aristotelians were Baconians.

This essay takes logic and ethics in broad senses: logic as the science of evidence; ethics as the science justice. One of its main conclusions is that neither science can be fruitfully pursued without the virtues fostered by the other: logic is pointless without fairness and compassion; ethics is pointless without rigor and objectivity. The logician urging us to be dispassionate is in resonance and harmony with the ethicist urging us to be compassionate.

This paper raises obvious questions undermining any residual confidence in Mates work and revealing our embarrassing ignorance of true nature of Stoic deduction. It was inspired by the challenging exploratory work of JOSIAH GOULD.

In this paper I articulate a view of doxastic control that helps defend the legitimacy of our practice of blaming people for their beliefs. I distinguish between three types of doxastic control: intention-based, reason-based, and influence-based. First I argue that, although we lack direct intention-based control over our beliefs, such control is not necessary for legitimate doxastic blame. Second, I suggest that we distinguish two types of reason-responsiveness: sensitivity to reasons and appreciation of reasons. I argue that while both capacities (...) are necessary for satisfying the control condition, neither is sufficient. Finally, I defend an influence-based view of doxastic control according to which we have the capacity to execute intentions to engage in reflection that causally influences our beliefs in positive epistemic ways. This capacity is both necessary and sufficient for satisfying the control condition for legitimate doxastic blame. I end by defending the view from two objections: that reflection is not necessary for meeting the control condition, and that it is not sufficient. (shrink)

A dilemma exists when a doctor is faced with a child or young person who refuses medically indicated treatment. The Gillick case has been interpreted by many to mean that a child of sufficient age and intelligence could validly consent or refuse consent to treatment. Recent decisions of the Court of Appeal on a child's refusal of medical treatment have clouded the issue and undermined the spirit of the Gillick decision and the Children Act 1989. It is now the case (...) that a child patient whose competence is in doubt will be found rational if he or she accepts the proposal to treat but may be found incompetent if he or she disagrees. Practitioners are alerted to the anomalies now exhibited by the law on the issue of children's consent and refusal. The impact of the decisions from the perspectives of medicine, ethics, and the law are examined. Practitioners should review each case of child care carefully and in cases of doubt seek legal advice. (shrink)

Technological developments have resulted in tremendous increases in the volume and diversity of the data and information that must be processed in the course of biomedical and clinical research and practice. Researchers are at the same time under ever greater pressure to share data and to take steps to ensure that data resources are interoperable. The use of ontologies to annotate data has proven successful in supporting these goals and in providing new possibilities for the automated processing of data and (...) information. In this chapter, we describe different types of vocabulary resources and emphasize those features of formal ontologies that make them most useful for computational applications. We describe current uses of ontologies and discuss future goals for ontology-based computing, focusing on its use in the field of infectious diseases. We review the largest and most widely used vocabulary resources relevant to the study of infectious diseases and conclude with a description of the Infectious Disease Ontology (IDO) suite of interoperable ontology modules that together cover the entire infectious disease domain. (shrink)

This paper shows that Russell’s theory of descriptions gives the wrong se-mantics for definite descriptions occurring in questions and imperatives. Depending on how that theory is applied, it either assigns nonsense to per-fectly meaningful questions and assertions or it assigns meanings that di-verge from the actual semantics of such sentences, even after all pragmatic and contextual variables are allowed for. Given that Russell’s theory is wrong for questions and assertions, it must be wrong for assertoric state-ments; for the semantics of (...) ‘the phi’ obviously doesn’t vary depending on whether it occurs in a question or an assertion or a command. (shrink)

The paper will explicate the Sache or matter of the dialectic of the founder of Kyoto School philosophy, Nishida Kitarō (1870-1945), from the standpoint of his mature thought, especially from the 1930s and 40s. Rather than providing a simple exposition of his thought I will engage in a creative reading of his concept of basho (place) in terms of chiasma and chōra, or a chiasmatic chōra. I argue that Nishida’s appropriation of nineteenth century German, especially Hegelian, terminology was inadequate in (...) expressing what he strove to say—for his concept of basho confounds traditional metaphysical discourse. Because of its chiasmatic and chōratic nature, the Sache he strove to capture and express through the language of dialectical philosophy, perpetually slips away from any systemic bounds. His “dialectic” (benshōhō) implies a chiasma or a criss-crossing of multiple factors on multi-dimensional levels that exceed in complexity simplistic binomial oppositions or the triadic formula of traditional dialectics. The complexity is one of over-determination that threatens to undermine the very language of such a dialectic. As the deep complexity of over-inter-determinations would deconstruct any notion of a substance, what Nishida offers—as opposed to an ousiology (or logic of substance)—is a chiasmology. I thus argue that his so-called dialectic is really an unfolding of that chiasma. And if chiasma expresses the over-determinate aspect of Nishida’s matter of thinking, chōra would express its under-determinate aspect. Nishida himself based his concept of basho or “place” on Plato’s notion of the chōra from the Timaeus. I take Nishida’s basho in its chōratic nature as what simultaneously unfolds and enfolds the chiasma. But in the case of the chōra it is its under-determinate nature that refuses reduction to any of the terms of opposition. In its self-withdrawal, it provides a clearing, a space, for the chiasmatic unraveling of the many. Like the chiasma it undermines any claim to a first substance or the hegemony of a universal First. For in its indeterminateness, it is “nothing” (mu). The unfolding it enfolds is, as Nishida states, “a determination without determiner.” In concrete terms, however, we might develop Nishida’s concept further by returning to the original pre-Platonic Greek meaning of chōra in the sense of “region” or “country,” to understand chōra or basho here as the very space of co-existence provided by this very earth. As a chiasmatic chōra irreducible, in its over- and under-determinations, to being or non-being, Nishida’s basho qua mu proves to be the an-ontological origin of both on and meon (being and non-being). Rejecting the culture-nature dichotomy this notion of our place of being as chiasma and chōra underscores our holistic symbiosis with the earth as the anontological (un)ground and clearing for our co-existence in a concrete milieau with one another and with nature. It is this earth as our ultimate contextual wherein that provides a clearing for co-dwelling and mutual encounter with one’s other, that we must acknowledge today if we are to co-exist authentically and freely vis-à-vis our global neighbors and vis-à-vis the surrounding nature. (shrink)

Sense-perceptions do not have to be deciphered if their contents are to be uploaded, the reason being that they are presentations, not representations. Linguistic expressions do have to be deciphered if their contents are to be uploaded, the reason being that they are representations, not presentations. It is viciously regressive to suppose that information-bearing mental entities are categorically in the nature of representations, as opposed to presentations, and it is therefore incoherent to suppose that thought is mediated by expressions or, (...) therefore, by linguistic entities. Attempts to neutralize this criticism inevitably overextend the concept of what it is to be a linguistic symbol, the result being that such attempts eviscerate the very position that it is their purpose to defend. Also, it is inherent in the nature of such attempts that they assume the truth of the view that for a given mental entity to bear this as opposed to that information is for that entity to have this as opposed to that causal role. This view is demonstrably false, dooming to failure the just-mentioned attempts to defend the contention that thought is in all cases mediated by linguistic symbols. (shrink)

A content theory of art would identify an artwork with the meaningful or representational content of some concrete artistic vehicle, such as the intentional, expressive, stylistic, and subject matter-related content embodied in, or resulting from, acts of intentional artistic expression by artists. Perhaps surprisingly, the resultant view that an artwork is nothing but content seems to have been without theoretical defenders until very recently, leaving a significant theoretical gap in the literature. I present some basic arguments in defence of such (...) a view, including the following. Content views of linguistic communication are ubiquitous, so why should they not be applicable in artistic cases as well? Also, propositional accounts of language involve two kinds of content (the proposition expressed by a sentence, plus the worldly state of affairs it represents), both of which kinds can be used in explaining artworks. In addition, the differing modal properties of artworks and concrete artefacts can be used to show that artworks could not be, or include, such physical artefacts. (shrink)

Advocates of communal living often urge that life in a commune provides the framework for a deeper knowledge of other people. I believe this is clearly true and because it is true, communal living is also instrumental in promoting self knowledge. The dialogue that is part of the life of a commune enables one to incorporate the insights of the other members into his understanding of himself and his world.

In "A Restriction for Pictures and Some Consequences for a Theory of Depiction", Journal of Aesthetics and Art Criticism 61, 4 (2003): 381-394, Michael Newall defended a resemblance view of depiction. He concentrated on pictures X involving a perpendicular view of the physical surface of another picture Y, and argued that the actual restrictions on what picture X can depict of Y's physical surface are best explained by a strict resemblance or similarity view. But I show that there are many (...) problems with his approach, so that overall it is no more successful than more standard resemblance views of depiction. (shrink)

Philosophy is the science of the science; it is the analysis of the assumptions underlying empirical inquiry. Given that these assumptions cannot possibly be examined or even identified on the basis of empirical data, it follows that philosophy is a non-empirical discipline. And given that our linguistic and cultural practices cannot possibly be examined or even identified except on the basis of empirical data, it follows that philosophical questions are not linguistic questions and do not otherwise concern our conventions or (...) our cultural practices. This entails that philosophical truths are not tautologous or otherwise trivial. It also entails that empiricism is false and, therefore, that Platonism is correct. Given a clear understanding of why Platonism is correct and of what this implies, a number of shibboleths of contemporary analytic philosophy are speedily demolished and are no less speedily replaced with independently corroborated and intuitively plausible alternatives. New answers are given to age-old questions concerning scientific explanation, causal and logical dependence, linguistic meaning, personal identity, the structure of the psyche, and the nature of personal responsibility. Existing answers to these question are thoroughly considered and duly extended, modified, or replaced. Every technical term is defined; every philosophy-specific concept is explained; and the positions defended are consistent with commonsense, so far as their being consistent with the relevant data allows them to be. Therefore, this book is intelligible to philosophically minded laymen. At the same time, it is appropriate for advanced scholars, given that it defends original viewpoints and given also that, even though it discusses old viewpoints, it does so in new ways. Because it is clearly written, it is intelligible to neophytes; but it is not an introductory text and it is not a textbook. There are two appendices: the first, a thorough exposition of the rudiments of formal logic, along with the conceptual underpinnings of that discipline; the second, a definition and analytic discussion of each technical term that occurs in the text. Most of the chapters are followed by study-questions and by practice tests. (shrink)

In this paper, I solve a puzzle generated by three conflicting claims about the relationship between faith, belief, and control: according to the Identity Thesis, faith is a type of belief, and according to Fideistic Voluntarism, we sometimes have control over whether or not we have faith, but according to Doxastic Involuntarism, we never have control over what we believe. To solve the puzzle, I argue that the Identity Thesis is true, but that either Fideistic Voluntarism or Doxastic Voluntarism is (...) false, depending on how we understand "control." I distinguish two notions of control: direct intention-based control and indirect reflective control. I argue that though we have direct intention-based control over neither belief nor faith, we have indirect reflective control over each of them. Moreover, indirect reflective control helps explain how we can be held accountable for each. (shrink)

Issues about the nature and ontology of works of art play a central part in contemporary aesthetics. But such issues are complicated by the fact that there seem to be two fundamentally different kinds of artworks. First, a visual artwork such as a picture or drawing seems to be closely identified with a particular physical object, in that even an exact copy of it does not count as being genuinely the same work of art. Nelson Goodman describes such works as (...) being “autographic.” Second, other artworks such as musical or literary works seem to be copyable without any such limitations: for example, two identical copies of a novel could each equally be a genuine instance of that novel; such works are “allographic,” in Goodman’s terminology. Nevertheless, it seems clear enough that a deeper understanding of both kinds of artworks requires the pursuit of analogies or similarities between them, in spite of their differences. Any such analogies that may be found will provide critical tests for more general theories about the nature of artworks. I show how to resolve such analogies for the orientational concept of inversion. (shrink)

The expressions ‘form’, ‘structure’, ‘schema’, ‘shape’, ‘pattern’, ‘figure’, ‘mold’, and related locutions are used in logic both as technical terms and in metaphors. This paper juxtaposes, distinguishes, and analyses uses of [FOR these PUT such] expressions by logicians. No [FOR such PUT similar] project has been attempted previously. After establishing general terminology, we present a variant of traditional usage of the expression ‘logical form’ followed by a discussion of the usage found in the two-volume Chateaubriand book Logical Forms (2001 and (...) 2005)—the most comprehensive work on the subject ever written and in many ways the focus of this paper. Key Words: morphology, character, sense, sentence, proposition, form, structure, schema, alternative constituent, type, token . (shrink)

Peter H. Hare (1935-2008) developed informed, original views about the proposition: some published (Hare 1969 and Hare-Madden 1975); some expressed in conversations at scores of meetings of the Buffalo Logic Colloquium and at dinners following. The published views were expository and critical responses to publications by Curt J. Ducasse (1881-1969), a well-known presence in American logic, a founder of the Association for Symbolic Logic and its President for one term.1Hare was already prominent in the University of Buffalo's Philosophy Department in (...) 1969 when I was appointed. Soon after, he became Chair. As his Associate Chair from 1971to 1975, I spent many hours with him in Buffalo and on professional trips .. (shrink)

This is an introduction to the section on Music and Politics including a description of the context of these essays, their individual contributions and their thematic interrelations.

The highly enjoyable experiences associated with drinking good wines have been widely misunderstood. It is common to regard wine appreciation as an analytical or quasi-scientific kind of activity, in which wine experts carefully distinguish the precise sensory qualities of each wine, and then pass on their accumulated factual knowledge to less experienced wine enthusiasts. However, this model of wine appreciation is seriously defective. One good way to show its defects is to provide a better and more fundamental scientific account of (...) what is involved in wine appreciation. In order to do so, I outline a novel, evolutionarily based theory of perceptual consciousness that explains why there must be imaginative as well as analytical kinds of experiences of wines. In addition, imaginative wine experiences, unlike typical imaginative artistic experiences, may be shown to involve highly individualistic, improvisatory elements that help to give wine drinking a unique place among the recreational arts. (shrink)

In this chapter, we explore whether agents have an epistemic duty to eradicate implicit bias. Recent research shows that implicit biases are widespread and they have a wide variety of epistemic effects on our doxastic attitudes. First, we offer some examples and features of implicit biases. Second, we clarify what it means to have an epistemic duty, and discuss the kind of epistemic duties we might have regarding implicit bias. Third, we argue that we have an epistemic duty to eradicate (...) implicit biases that have negative epistemic impact. Finally, we defend this view against the objection that we lack the relevant control over implicit bias that’s required for such a duty. We argue that we have a kind of reflective control over the implicit biases that we are duty-bound to eradicate. And since, as we show, we have this control over a wide variety of implicit biases, there are a lot of implicit biases that we have epistemic duties to eradicate. (shrink)

Eleonore Stump insightfully develops Aquinas’s theodicy to account for a significant source of human suffering, namely the undermining of desires of the heart. Stump argues that what justifies God in allowing such suffering are benefits made available to the sufferer through her suffering that can defeat the suffering by contributing to the fulfillment of her heart’s desires. We summarize Stump’s arguments for why such suffering requires defeat and how it is defeated. We identify three problems with Stump’s account of how (...) such suffering is defeated and offer solutions to each. We defend and strengthen Stump’s response to the hardest cases for her view, and explain what her view demands of God. (shrink)

This is an excellent book that deserves careful attention from anyone whose work touches on issues in the philosophy of mind and action. In it, Marcus challenges the dominant philosophical conception of the mind’s place in nature, according to which mentalistic explanations hold true only when mental states or events cause things to happen in the same way as physical states and events do. Against this conception, Marcus argues that mental causation is utterly dissimilar to most of the causation we (...) find in the physical realm, and that psychological achievements like believing and acting for reasons should be understood as manifestations of the rational ability self-consciously to represent good-making relations as holding between propositions and actions. (shrink)

In this well-structured monograph, Stephen A. McKnight seeks to correct the view that Francis Bacon’s use of religious motifs and tropes is “manipulative,” “cynical,” and “disingenuous,” a view McKnight considers the “prevailing” one. To accomplish his goal, McKnight subjects several of Bacon’s works to a close reading. He concludes that the “pervasiveness of religious motifs, scriptural references, and biblical doctrines” in Bacon’s writings “establish the central role religion plays in Bacon’s thought”. McKnight holds that Bacon’s religiosity is not disingenuous, but (...) sincere. . . . . In documenting religious motifs in several of Bacon’s writings, this book is a valuable success. In characterizing Bacon’s religious beliefs and how they influenced the rest of his thought, it is much less convincing. (shrink)

Technological developments have resulted in tremendous increases in the volume and diversity of the data and information that must be processed in the course of biomedical and clinical research and practice. Researchers are at the same time under ever greater pressure to share data and to take steps to ensure that data resources are interoperable. The use of ontologies to annotate data has proven successful in supporting these goals and in providing new possibilities for the automated processing of data and (...) information. In this chapter, we describe different types of vocabulary resources and emphasize those features of formal ontologies that make them most useful for computational applications. We describe current uses of ontologies and discuss future goals for ontology-based computing, focusing on its use in the field of infectious diseases. We review the largest and most widely used vocabulary resources relevant to the study of infectious diseases and conclude with a description of the Infectious Disease Ontology (IDO) suite of interoperable ontology modules that together cover the entire infectious disease domain. (shrink)

Sgarbi just shows that in the century before Locke’s Essay Concerning Human Understanding many writers mentioned induction and many claimed that knowledge must rely somehow on sense experience. An attempt to revive Randall’s thesis needs more than that.