The Foundational Model of Anatomy (FMA) is a map of the human body. Like maps of other sorts – including the map-like representations we find in familiar anatomical atlases – it is a representation of a certain portion of spatial reality as it exists at a certain (idealized) instant of time. But unlike other maps, the FMA comes in the form of a sophisticated ontology of its objectdomain, comprising some 1.5 million statements of anatomical relations among some 70,000 anatomical kinds. (...) It is further distinguished from other maps in that it represents not some specific portion of spatial reality (say: Leeds in 1996), but rather the generalized or idealized spatial reality associated with a generalized or idealized human being at some generalized or idealized instant of time. It will be our concern in what follows to outline the approach to ontology that is represented by the FMA and to argue that it can serve as the basis for a new type of anatomical information science. We also draw some implications for our understanding of spatial reasoning and spatial ontologies in general. (shrink)

Anatomically detailed dolls have been used to elicit testimony from children in sex abuse cases. However, studies have shown they often provide false accounts in young, preschool-age children. Typically this problem is seen as a cognitive one: with age, children can correctly map their bodies onto a doll due to greater intellectual ability to represent themselves. I argue, along with the work of Maurice Merleau-Ponty, that although certainly cognitive developments aid in representing one’s own body, a discussion of embodiment is (...) required in order to understand the use and abuse of anatomical dolls in forensic interviews. This paper will examine these issues and suggest that a better understanding of embodied perception in both adults and children helps show how phenomenology can provide a more nuanced understanding to a troubling ethical and legal problem. (shrink)

Objective: The coronoid fossa and the olecranon fossa located on the distal end of the humerus are separated by a thin bone septum. This septum may be translucent or opaque. In some cases, this septum may become perforated, and it is called supratrochlear foramen. The aim of the present study was to describe the morphology of the supratrochlear foramen of the humerus. Methods: This study was conducted on 108 dry humeri (right (R): 56, left (L): 52) belonging to adults whose (...) age, gender, and racial properties are unknown. They were examined to determine the presence of the supratrochlear foramen. The shapes of the supratrochlear foramen were determined, and their diameters were measured. Results: The supratrochlear foramen was observed in 11 cases on the right side and 11 cases on the left side. On the right side, 5 foramens were detected to be round-shaped, 3 oval-shaped, and 3 kidney-shaped, whereas on the left side, 6 foramens were detected to be oval-shaped and 5 round-shaped. Of the 86 dry humeri with no supratrochlear foramen, 57 (R: 30, L: 27) had a translucent septum, and 29 (R: 15, L: 14) had an opaque septum. Conclusion: It is apparent that the supratrochlear foramen has been evaluated on bones generally in the literature, and there are differences in incidence rates. Owing to the clinical significance of this formation, it is thought that studying on a wider population of living individuals using radiologic imaging methods will contribute to the literature. In addition, although there are different terms used to express this formation in the literature, it is thought that adopting the name, which is commonly used as supratrochlear foramen, is most appropriate. (shrink)

Jerry Fodor and Ernest Lepore (1999/2002) frame the debate over meaning holism in terms of a distinction between meaning atomism and meaning anatomism. The former holds that the meaning of an expression E is determined by some relation between E and some extra-linguistic entity. The latter holds that the meaning of E is at least partly determined by some of E’s “inward” relations (IRs) with other expressions in the very language. They (1992) argue that meaning anatomism inevitably collapses (...) into meaning holism, which is the view that the meaning of E is determined by E’s IRs with every other expression in the very language because there is no principled distinction for the anatomist to divide the meaning-determining IRs from the non-meaning-determining ones. In response, the non-holistic anatomist urges that Fodor and Lepore’s no-principled-basis consideration is groundless because the lack of a generally accepted criterion for such a distinction does not undermine the viability of the distinction itself. While this point is well taken, I think that Fodor and Lepore are onto an important question here. That is, what does it make non-holistic anatomism distinctive from its holistic counterpart if without a principled basis for the distinction among IRs? I look into this question and give an alternative argument from Fodor and Lepore’s to suggest that non-holistic anatomism cannot bypass the no-principled-basis consideration. The non-holistic anatomist will need a principled distinction in kind between IRs to back her point. (shrink)

This paper explores the anatomical foundations of Aristotle's natural philosophy. Rather than simply looking at the body, he contrives specific procedures for revealing unmanifest phenomena. In some cases, these interventions seem extensive enough to qualify as experiments. At the work bench, one can observe the parts of animals in the manner Aristotle describes, even if his descriptions seem at odds with 20th century textbooks. Manipulating animals allows us to recover his teleological thought more fully. This consideration of Aristotle as a (...) sophisticated biologist helps our reading of his writings in other areas of philosophy. (shrink)

Intuitively, we can conceive of the existence of a conscious state as a pure activity that does not necessarily require a body (or even a brain). This idea has found new support in certain recent theories that present the possibility of a totally disconnected and disembodied consciousness. Against this hypothesis, I argue that human experience is intrinsically embodied and embedded, though in a specific way. Using Sartre’s phenomenology of the body, I first analyze the concept of consciousness as intentionality and (...) a world-disclosing activity, thus explaining how conscious activity can only be expressed through a body that is spatiotemporally related to the world. Then, I argue that bodily consciousness does not necessarily imply the actual presence of an anatomical body but, rather, a process of spatialization and temporalization (hodological space and temporal synthesis) through the “spatiotemporal body”. Finally, I test my thesis by critiquing some cases of apparent disembodied/disconnected consciousness, i.e., dreams, out-of-body experiences, and the brain-in-a-vat scenario. (shrink)

It is now increasingly accepted that many existing biological and medical ontologies can be improved by adopting tools and methods that bring a greater degree of logical and ontological rigor. In this chapter we will focus on the merits of a logically sound approach to ontologies from a methodological point of view. As we shall see, one crucial feature of a logically sound approach is that we have clear and functional definitions of the relational expressions such as ‘is a’ and (...) ‘part of ’. (shrink)

Objective: The nutrient artery which enters through the nutrient foramen (NF) provides blood circulation and nutrition in long bones. This supply is essential during the growing period, the early phases of ossification, and in some surgical procedures. This study aimed to investigate NF in adult human ulnas in the Turkish population. -/- Methods: For this study, 155 (70 right and 85 left) Turkish dry adult human ulnas were used. The presence, number, and patency of NF were recorded as well as (...) its topography and direction. The vertical distance between the most proximal point of the olecranon and the proximal edge of the NF (DONF), and the longitudinal distance between the most ventral point of the coronoid process on the sagittal plane and the proximal edge of the NF (DCpNF) was calculated. Additionally, the foraminal index (FI) was assessed. -/- Results: Single and double NFs were in 139 ulnas (89.67%), and 3 ulnas (1.94%), respectively. NFs were not observed in 13 ulnas (8.39%). The majority of NFs (93.12%) were situated on the anterior surface of the ulna. The direction of all NFs was towards the elbow. The mean DONF and DCpNF were 9.48 ± 1.57 cm, and 6.68 ± 1.44 cm, respectively. The FI was 37.45% in ulnas with a single NF, while it was 41.46% in ulnas with a double NF. -/- Conclusion: Our study has presented additional information such as the FI of ulnas with 2 NFs, and the distance between the coronoid process and NF in the Turkish population. (shrink)

Objective: Atlas is located at a critical point close to the vital centers of the medulla oblongata, which can be compressed by the dislocation of the atlantoaxial complex or instability of the atlantooccipital joint. This study aimed to determine in detail the morphometric and morphological characteristics of the atlas to guide the reduction of the risk of complications and increase the success rate in various surgical approaches for the craniovertebral junction. -/- Methods: In this study, 17 atlas vertebrae whose measurement (...) parameters were pronounced and unknown gender, age, and ethnic characteristics were examined. -/- Results: Totally 16 parameters, 11 of which were bilateral and 5 were unilateral, were examined on the atlas. Also, no accessory foramen transversarium was found in these atlas vertebrae. Of the 23 foramina transversaria that were prominent and not broken, 7 were found to be round-shaped (30.43%), and 16 were oval-shaped (69.57%). -/- Conclusion: It is deducted that the results obtained in this study will help to have information about the morphometry and morphology of atlas vertebrae. Although information such as age, gender, and ethnic origin is not known about the bones evaluated, it is the advantage of this study that a large number of parameters are evaluated and compared with previous publications. Nevertheless, it seems that there is a need for studies in which much more cases are assessed, and information such as age, gender, and ethnic origin is known. (shrink)

Scholarly opinions vary on what language is, how it evolved, and from where or what it evolved. Long considered uniquely human, today scholars argue for evolutionary continuity between human language and animal communication systems. But while it is generally recognized that language is an evolving communication system, scholars continue to debate from which species language evolved, and what behavioral and cognitive features are the precursors to human language. To understand the nature of protolanguage, some look for homologs in gene functionality, (...) brain areas, or anatomical structures such as the supralaryngeal vocal tract; others point toward primates, their gestural, vocal, multimodal, and in later evolving hominins also their pantomimic communication systems; and still others draw parallels between the musicality that characterizes language and the pitch found in the numerous sounds produced by animals. Accordingly, protolanguage theories today are multiple and diverse, and protolanguages might have also been diverse. This special issue on Evolving (Proto)Language/s for Lingua bundles several of the protolanguage theories that were put forward at the sixth edition of the Ways to Protolanguage conference series, held at the Calouste Gulbenkian Foundation in Lisbon, in 2019. Not aimed at surveying all the different ways there are to conceptualize, study, and model protolanguage/s, this issue provides interested readers with good overviews on the role played in current theorizing on protolanguage/s by (paleo)anthropology, genetics, physiology, developmental, evolutionary, ecological, and pragmatic research lines. (shrink)

The Foundational Model of Anatomy (FMA) symbolically represents the structural organization of the human body from the macromolecular to the macroscopic levels, with the goal of providing a robust and consistent scheme for classifying anatomical entities that is designed to serve as a reference ontology in biomedical informatics. Here we articulate the need for formally clarifying the is-a and part-of relations in the FMA and similar ontology and terminology systems. We diagnose certain characteristic errors in the treatment of these relations (...) and show how these errors can be avoided through adoption of the formalism we describe. We then illustrate how a consistently applied formal treatment of taxonomy and partonomy can support the alignment of ontologies. (shrink)

The Common Anatomy Reference Ontology (CARO) is being developed to facilitate interoperability between existing anatomy ontologies for different species, and will provide a template for building new anatomy ontologies. CARO has a structural axis of classification based on the top-level nodes of the Foundational Model of Anatomy. CARO will complement the developmental process sub-ontology of the GO Biological Process ontology, using it to ensure the coherent treatment of developmental stages, and to provide a common framework for the model organism communities (...) to classify developmental structures. Definitions for the types and relationships are being generated by a consortium of investigators from diverse backgrounds to ensure applicability to all organisms. CARO will support the coordination of cross-species ontologies at all levels of anatomical granularity by cross-referencing types within the cell type ontology (CL) and the Gene Ontology (GO) Cellular Component ontology. A complete cross-species CARO could be utilized in other ontologies for cross-product generation. (shrink)

Automatic detection of diseases and anatomical landmarks in medical images by the use of computers is important and considered a challenging process that could help medical diagnosis and reduce the cost and time of investigational procedures and refine health care systems all over the world. Recently, gastrointestinal (GI) tract disease diagnosis through endoscopic image classification is an active research area in the biomedical field. Several GI tract disease classification methods based on image processing and machine learning techniques have been proposed (...) by diverse research groups in the recent past. However, yet effective and comprehensive deep ensemble neural network-based classification model with high accuracy classification results is not available in the literature. In this thesis, we review ways and mechanisms to use deep learning techniques to research on multi-disease computer-aided detection about gastrointestinal and identify these images. We re-trained five state-of-the-art neural network architectures, VGG16, ResNet, MobileNet, Inception-v3, and Xception on the Kvasir dataset to classify eight categories that include an anatomical landmark (pylorus, z-line, cecum), a diseased state (esophagitis, ulcerative colitis, polyps), or a medical procedure (dyed lifted polyps, dyed resection margins) in the Gastrointestinal Tract. Our models have showed results with a promising accuracy which is a remarkable performance with respect to the state-of-the-art approaches. The resulting accuracies achieved using VGG, ResNet, MobileNet, Inception-v3, and Xception were 98.3%, 92.3%, 97.6%, 90% and 98.2%, respectively. As it appears, the most accurate result has been achieved when retraining VGG16 and Xception neural networks with accuracy reache to 98% due to its high performance on training on ImageNet dataset and internal structure that support classification problems. (shrink)

Traditionally, philosophers have appealed to the phenomenological similarity between visual experience and visual imagery to support the hypothesis that there is significant overlap between the perceptual and imaginative domains. The current evidence, however, is inconclusive: while evidence from transcranial brain stimulation seems to support this conclusion, neurophysiological evidence from brain lesion studies (e.g., from patients with brain lesions resulting in a loss of mental imagery but not a corresponding loss of perception and vice versa) indicates that there are functional and (...) anatomical dissociations between mental imagery and perception. Assuming that the mental imagery and perception do not overlap, at least, to the extent traditionally assumed, then the question arises as to what exactly mental imagery is and whether it parallels perception by proceeding via several functionally distinct mechanisms. In this review, we argue that even though there may not be a shared mechanism underlying vision for perception and conscious imagery, there is an overlap between the mechanisms underlying vision for action and unconscious visual imagery. On the basis of these findings, we propose a modification of Kosslyn’s model of imagery that accommodates unconscious imagination and explore possible explanations of the quasi-pictorial phenomenology of conscious visual imagery in light of the fact that its underlying neural substrates and mechanisms typically are distinct from those of visual experience. (shrink)

The Plant Ontology (PO; http://www.plantontology.org/) is a publicly-available, collaborative effort to develop and maintain a controlled, structured vocabulary (“ontology”) of terms to describe plant anatomy, morphology and the stages of plant development. The goals of the PO are to link (annotate) gene expression and phenotype data to plant structures and stages of plant development, using the data model adopted by the Gene Ontology. From its original design covering only rice, maize and Arabidopsis, the scope of the PO has been expanded (...) to include all green plants. The PO was the first multi-species anatomy ontology developed for the annotation of genes and phenotypes. Also, to our knowledge, it was one of the first biological ontologies that provides translations (via synonyms) in non-English languages such as Japanese and Spanish. There are about 2.2 million annotations linking PO terms to over 110,000 unique data objects representing genes or gene models, proteins, RNAs, germplasm and Quantitative Traits Loci (QTLs) from 22 plant species. In this paper, we focus on the plant anatomical entity branch of the PO, describing the organizing principles, resources available to users, and examples of how the PO is integrated into other plant genomics databases and web portals. We also provide two examples of comparative analyses, demonstrating how the ontology structure and PO-annotated data can be used to discover the patterns of expression of the LEAFY (LFY) and terpene synthase (TPS) gene homologs. (shrink)

During the microscopic anatomical study of a fresh water siluridfish, Wallago attu,a new trematode species Opisthorchis varunai was recorded from the gallbladder. The fish was collected from the Varuna River in Varanasi. The newly reported species has been described in detail, discussed and compared with other species of the genus Opisthorchis. It has elongated spinose body, bluntly pointed at anterior and posterior extremities, entire ovary, ventral sucker pre-equatorial, unlobed testes and presence of pre-pharynx. It has been distinguished by other species (...) through the absence of a crown of spines around the excretory pore. (shrink)

Proponents of ontic conceptions of explanation require all explanations to be backed by causal, constitutive, or similar relations. Among their justifications is that only ontic conceptions can do justice to the ‘directionality’ of explanation, i.e., the requirement that if X explains Y , then not-Y does not explain not-X . Using topological explanations as an illustration, we argue that non-ontic conceptions of explanation have ample resources for securing the directionality of explanations. The different ways in which neuroscientists rely on multiplexes (...) involving both functional and anatomical connectivity in their topological explanations vividly illustrate why ontic considerations are frequently (if not always) irrelevant to explanatory directionality. Therefore, directionality poses no problem to non-ontic conceptions of explanation. (shrink)

In contemporary healthcare, medical image categorization is essential for illness prediction, diagnosis, and therapy planning. The emergence of digital imaging technology has led to a significant increase in research into the use of machine learning (ML) techniques for the categorization of images in medical data. We provide a thorough summary of recent developments in this area in this review, using knowledge from the most recent research and cutting-edge methods.We begin by discussing the unique challenges and opportunities associated with medical image (...) classification, including the complexity of anatomical structures, variability in imaging modalities, and the need for interpretability and reliability in clinical settings. Subsequently, we survey a wide range of ML algorithms and techniques employed for medical image classification, including traditional methods such as support vector machines and k-nearest neighbors, as well as deep learning approaches like convolutional neural networks (CNNs) and recurrent neural networks (RNNs). Furthermore, we examine key considerations in dataset preparation, feature extraction, and model evaluation specific to medical image classification tasks. We highlight the importance of large, annotated datasets, transfer learning, and data augmentation techniques in enhancing model performance and generalization. (shrink)

John Corcoran. 1979 Review of Hintikka and Remes. The Method of Analysis (Reidel, 1974). Mathematical Reviews 58 3202 #21388. -/- The “method of analysis” is a technique used by ancient Greek mathematicians (and perhaps by Descartes, Newton, and others) in connection with discovery of proofs of difficult theorems and in connection with discovery of constructions of elusive geometric figures. Although this method was originally applied in geometry, its later application to number played an important role in the early development of (...) algebra [Jacob Klein, English translation, Greek mathematical thought and the origin of algebra, especially pp. 154–157, M.I.T. Press, Cambridge, Mass., 1968]. -/- It is universally agreed that the method of analysis begins by “assuming the thing sought after” (e.g., in geometry, the truth of the proposition to be proved or the existence of the geometric figure to be constructed). Aside from this, little else can be taken for granted. There is disagreement concerning the “direction of analysis”, i.e. whether one is to seek implications of the assumption or whether one is to seek implicants of it. There is also disagreement concerning what is to be “anatomized” (analyzed), i.e., whether one analyzes mathematical objects (figures), mathematical propositions (the axioms, known theorems, and analytic assumption) or an imagined proof (of the analytic assumption from axioms and known theorems). (shrink)

Autism has been defined as a disorder of social cognition, interaction and communication where ritualistic, repetitive behaviors are commonly observed. But how should we understand the behavioral and cognitive differences that have been the main focus of so much autism research? Can high-level cognitive processes and behaviors be identified as the core issues people with autism face, or do these characteristics perhaps often rather reflect individual attempts to cope with underlying physiological issues? Much research presented in this volume will point (...) to the latter possibility, i.e. that people on the autism spectrum cope with issues at much lower physiological levels pertaining not only to Central Nervous Systems (CNS) function, but also to peripheral and autonomic systems (PNS, ANS) (Torres, Brincker, et al. 2013). The question that we pursue in this chapter is what might be fruitful ways of gaining objective measures of the large-scale systemic and heterogeneous effects of early atypical neurodevelopment; how to track their evolution over time and how to identify critical changes along the continuum of human development and aging. We suggest that the study of movement variability—very broadly conceived as including all minute fluctuations in bodily rhythms and their rates of change over time (coined micro-movements (Figure 1A-B) (Torres, Brincker, et al. 2013))—offers a uniquely valuable and entirely objectively quantifiable lens to better assess, understand and track not only autism but cognitive development and degeneration in general. This chapter presents the rationale firstly behind this focus on micro-movements and secondly behind the choice of specific kinds of data collection and statistical metrics as tools of analysis (Figure 1C). In brief the proposal is that the micro-movements (defined in Part I – Chapter 1), obtained using various time scales applied to different physiological data-types (Figure 1), contain information about layered influences and temporal adaptations, transformations and integrations across anatomically semi-independent subsystems that crosstalk and interact. Further, the notion of sensorimotor re-afference is used to highlight the fact that these layered micro-motions are sensed and that this sensory feedback plays a crucial role in the generation and control of movements in the first place. In other words, the measurements of various motoric and rhythmic variations provide an access point not only to the “motor systems”, but also access to much broader central and peripheral sensorimotor and regulatory systems. Lastly, we posit that this new lens can also be used to capture influences from systems of multiple entry points or collaborative control and regulation, such as those that emerge during dyadic social interactions. (shrink)

Information was a frequently used concept in many fields of investigation. However, this concept is still not really understood, when it is referred for instance to consciousness and its informational structure. In this paper it is followed the concept of information from philosophical to physics perspective, showing especially how this concept could be extended to matter in general and to the living in particular, as a result of the intimate interaction between matter and information, the human body appearing as a (...) bipolar informed-matter structure. It is detailed on this way how this concept could be referred to consciousness, and an informational modeling of consciousness as an informational system of the human body is presented. Based on the anatomic architecture of the organism and on the inference of the specific information concepts, it is shown that the informational system of the human body could be described by seven informational subsystems, which are reflected in consciousness as corresponding cognitive centers. These results are able to explain the main properties of consciousness, both the cognitive and extra-cognitive properties of the mind, like that observed during the near-death experiences and other similar phenomena. Moreover, the results of such a modeling are compared with the existing empirical concepts and models on the energetic architecture of the organism, showing their relevance for the understanding of consciousness. (shrink)

Traditionally defined as the science of the living, or as the field that beyond anatomical structure and bodily form studies functional organization and behaviour, physiology has long been excluded from evolutionary research. The main reason for this exclusion is that physiology has a presential and futuristic outlook on life, while evolutionary theory is traditionally defined as the study of natural history. In this paper, I re-evaluate these classic science divisions and situate physiology within the history of the evolutionary sciences, as (...) well as within debates on the Extended Evolutionary Synthesis and the need for a Third Way of Evolution. I then briefly point out how evolutionary physiology in particular contributes to research on function, causation, teleonomy, agency and cognition. (shrink)

Visual imagery is a form of sensory imagination, involving subjective experiences typically described as similar to perception, but which occur in the absence of corresponding external stimuli. We used the Activation Likelihood Estimation algorithm (ALE) to identify regions consistently activated by visual imagery across 40 neuroimaging studies, the first such meta-analysis. We also employed a recently developed multi-modal parcellation of the human brain to attribute stereotactic co-ordinates to one of 180 anatomical regions, the first time this approach has been combined (...) with the ALE algorithm. We identified a total 634 foci, based on measurements from 464 participants. Our overall comparison identified activation in the superior parietal lobule, particularly in the left hemisphere, consistent with the proposed ‘top-down’ role for this brain region in imagery. Inferior premotor areas and the inferior frontal sulcus were reliably activated, a finding consistent with the prominent semantic demands made by many visual imagery tasks. We observed bilateral activation in several areas associated with the integration of eye movements and visual information, including the supplementary and cingulate eye fields (SCEFs) and the frontal eye fields (FEFs), suggesting that enactive processes are important in visual imagery. V1 was typically activated during visual imagery, even when participants have their eyes closed, consistent with influential depictive theories of visual imagery. Temporal lobe activation was restricted to area PH and regions of the fusiform gyrus, adjacent to the fusiform face complex (FFC). These results provide a secure foundation for future work to characterise in greater detail the functional contributions of specific areas to visual imagery. (shrink)

In this paper, I argue that for the purposes of ordinary reasoning, sentences about properties of concrete objects can be replaced with sentences concerning how things in our universe would be related to inscriptions were there a pluriverse. Speaking loosely, pluriverses are composites of universes that collectively realize every way a universe could possibly be. As such, pluriverses exhaust all possible meanings that inscriptions could take. Moreover, because universes necessarily do not influence one another, our universe would not be any (...) different intrinsically if there were a pluriverse. These two facts enable anti-realists about abstract objects to replace, e.g. talk of anatomical features with talk of the inscriptions concerning anatomical structure that would exist were there a pluriverse. The availability of such replacements enables anti-realists to carry out essential ordinary reasoning without referring to properties, thereby making room for a consistent anti-realist worldview. The inscriptions of the would-be pluriverse are so numerous and varied that sentences about them can play the roles in ordinary reasoning served by simple sentences about properties of concrete objects. (shrink)

In this article, we discuss the modularity of the emotions. In a general methodological section, we discuss the empirical basis for the postulation of modularity. Then we discuss how certain modules -- the emotions in particular -- decompose into distinct anatomical and functional parts.

Explanations in behavioural neuroscience are often said to be mechanistic in the sense that they explain an organism’s behaviour by describing the activities and organisation of the organism’s parts that are “constitutively relevant” to organism behaviour. Much has been said about the constitutive relevance of working parts (in debates about the so-called “mutual manipulability criterion”), but relatively little has been said about the constitutive relevance of the organising relations between working parts. Some New Mechanists seem to endorse a simple causal-linking (...) account: organising relations are constitutively relevant to organism behaviour if and only if (and because) they are causal relations that link the working parts that are constitutively relevant to organism behaviour. In this paper, I argue that the causal-linking account is inadequate because it neglects the constitutive relevance of anatomical relations that organise the working parts of a behaving organism. I demonstrate this by considering a case study where the anatomical organisation of the barn owl (Tyto alba) is constitutively relevant to their mechanism for sound localization. The anatomical organisation of this mechanism is best understood as the back-and-forth flow of task information across 7 “levels of anatomy” (a notion that I distinguish from levels of mechanism). A further implication, I conclude, is that at least some of the interlevel structure of neuroscientific explanation is accounted for by levels of anatomy, not levels of mechanism. (shrink)

This paper describes the scientific practices of the anatomists from the Société Anatomique de Paris (1803–1873) who were collecting anatomical and pathological specimens in Nineteenth-Century Paris and which led to the building of the anatomy and pathology Musée Dupuytren (1835–2016). The framework introduced by Robert Kohler to describe collecting sciences (2007) is useful as a tool to identify the set of diverse practices within pathological anatomy in nineteenth-century Paris. However, I will argue that anatomy and pathology collecting had specific features (...) compared to most collecting sciences. Two main collecting practices could be distinguished: first, “finding” anatomical specimens and second, keeping these specimens. The first kind of practices were at least rhetorically and explicitly motivated by Auguste Comte’s positive philosophy. But “finding” an anatomy or pathology specimen could not be completely compared to finding an object or making a simple observation, as dissecting as well as some experimental practices were also involved. Heterogeneous practices thus coexisted within collecting in anatomy and pathology. Epistemological as well as pragmatic tensions arose. On top of Kohler’s framework, I introduce Sabina Leonelli’s concept of “data journey” to offer a narrative of the diversity of collecting practices involved in the Société Anatomique de Paris and the Musée Dupuytren. I use the concept to analyse how this diversity of practices impacted knowledge production. (shrink)

An academic division of labor resulted from the distinction between sex and gender. Sex remained a productive topic (excuse the pun) for biologists, who are interested in the genetic, developmental, and chemical pathways of male/female dimorphism. People in the social sciences and humanities, by contrast, made gender, not sex, the subject of their work. In gender studies, we learn about the ways that men and women “perform” their respective roles—people of male sex can perform as female gender, and vice versa, (...) by adopting modes of speech, dress, behavior, and even values. There is no talk of innate instincts or brain differences in gender studies. The French philosopher Michel Foucault set the agenda when he lamented, as early as 1976, that “the notion of sex made it possible to group together, in an artificial unity, anatomical elements, biological functions, conducts, sensations, and pleasures, and it enabled one to make use of this fictitious unity as a causal principle.” Following this approach, more-recent theorists like Anne Fausto-Sterling and Judith Butler have argued that even the biological categories of sex are just artificial inventions, designed to keep women and intersexed peoples down. Society, they suggest, decides which of us are males and which are females—pushing everyone into rigid binary categories. -/- There are two main arguments that are usually offered in defense of this controversial thesis that sexual dimorphism is political rather than ontological. One is based on a general critique of knowledge (an epistemological argument), and the other on a specific picture of reality (a metaphysical argument). I will offer counterarguments to both. (shrink)

Universal Darwinism provides a methodology to study the evolution of anatomical form and sociocultural behavior that centers on defining the units and levels of selection, and it identifies the conditions whereby natural selection operates. In previous work, I have examined how this selection-focused evolutionary epistemology may be universalized to include theories that associate with an extended synthesis. Applied evolutionary epistemology is a metatheoretical framework that understands any and all kinds of evolution as phenomena where units evolve by mechanisms at levels (...) of an ontological hierarchy; and it provides three heuristics to search for these units, levels and mechanisms. The heuristics are applicable to language and sociocultural evolution, and here, we give an in-depth analysis of how the unit-heuristic can be implemented into language origin and evolution studies. The importance of developing hierarchy theories is also more fully explained. (shrink)

Objective: The aim of our study is to reveal the errors that can be encountered during the shooting of photogrammetric studies on the lower extremities. -/- Methods: We revealed the necessary tools that used during photogrammetry measurements of the lower limb. Also, the errors have been encountered of our two previous studies performed on photogrammetry of lower limbs. The technical errors or incorrect positioning of 20 from 220 volunteers were encountered. -/- Results: The identified errors of 20 volunteers’ photographs related (...) to lower limb were about the inadequate quality image, calibration, poor lightining, positioning error of trunk or parts of lower limb and clothes that cover the anatomical points affected the measurements. -/- Conclusion: Photogrammetry is an important and useful tool for evaluation, diagnosis, treatment, and efficacy monitoring. In anatomy, it is frequently used as a time-saving method in terms of measurement and evaluation in the laboratory, which can be applied and repeated for research. For this reason, errors that occur during the lower extremity have been reported and we think that it will be useful for studies on this part of the body and can be a guide. (shrink)

A medical intervention is a medical procedure or application intended to relieve or prevent illness or injury. Examples of medical interventions include vaccination and drug administration. After a medical intervention, adverse events (AEs) may occur which lie outside the intended consequences of the intervention. The representation and analysis of AEs are critical to the improvement of public health. Description: The Ontology of Adverse Events (OAE), previously named Adverse Event Ontology (AEO), is a community-driven ontology developed to standardize and integrate data (...) relating to AEs arising subsequent to medical interventions, as well as to support computer-assisted reasoning. OAE has over 3,000 terms with unique identifiers, including terms imported from existing ontologies and more than 1,800 OAE-specific terms. In OAE, the term ‘adverse event’ denotes a pathological bodily process in a patient that occurs after a medical intervention. Causal adverse events are defined by OAE as those events that are causal consequences of a medical intervention. OAE represents various adverse events based on patient anatomic regions and clinical outcomes, including symptoms, signs, and abnormal processes. OAE has been used in the analysis of several different sorts of vaccine and drug adverse event data. (shrink)

There is an interesting historical detour in the dissemination of one of the seventeenth century’s most praised discoveries: the reception of Harvey’s account of the circulation of the blood is closely intertwined, especially in the Low Countries, with Descartes’ account of the origin of the heartbeat. Descartes was one of the first figures to support the circulation of the blood and to give credit to Harvey for it, although he presumably arrived at the same conclusion independently through his own anatomical (...) experiments. He did so while vocally rejecting Harvey’s views on the muscular nature of the heart and his explanation of cardiac motion, to promote his own mechanistic solutions instead. Although Descartes’ .. (shrink)

Recognition of the plasticity of development — from gene expression to neuroplasticity — is increasingly undermining the traditional distinction between structure and function, or anatomy and behavior. At the same time, dynamic systems theory — a set of tools and concepts drawn from the physical sciences — has emerged as a way of describing what Maurice Merleau-Ponty calls the “dynamic anatomy” of the living organism. This article surveys and synthesizes dynamic systems models of development from biology, neuroscience, and psychology in (...) order to propose an integrated account of growth, learning, and behavior. Key to this account is the concept of self-differentiation or symmetry-breaking. I argue that development can be understood as a cascade of symmetry-breaking events brought about by the ongoing interactions of multiple, nested, nonlinear dynamic systems whose self-organizing behaviors gradually alter their own anatomical conditions. I begin by introducing the concept of symmetry-breaking as a way of understanding anatomical development. I then extend this approach to motor development by arguing that the organism’s behavior grows along with its body, like a new organ. Finally, I argue that the organism’s behavior and its world grow together dialectically, each driving the other to become more complex and asymmetrical through its own increasing asymmetry. Thus development turns out to be a form of cognition or sense-making, and cognition a form of development. (shrink)

Contemporary neuroscientific theories of consciousness are typically based on the study of vision and have neglected olfaction. Several of these (e.g. Global Workspace Theories, the Information Integration theory, and the various theories offered by Crick and Koch) claim that a thalamic relay is necessary for consciousness. Studies on olfaction and the olfactory system's anatomical structure show this claim to be incorrect, thus showing these theories to be either false or inadequate as general and comprehensive accounts of consciousness. Attempts to rescue (...) these theories by claiming that there is a structure in the olfactory system that is functionally equivalent to the thalamus in the visual system, such as the olfactory bulb or the olfactory cortex, are also shown to fail. If we wish to understand consciousness, we have to wake up and smell it. (shrink)

In this essay, our goal is to discover science in Martin Heidegger's Introduction to Metaphysics, lecture notes for his 1935 summer semester course, because, after all, his subject is metaphysica generalis, or ontology, and this could be construed as a theory of the human brain. Here, by means of verbatim quotes from his text, we attempt to show that indeed these lectures can be viewed as suggestion for an objective scientific theory of human perception, the human capacity for deciphering phenomena, (...) ie. hermeneutics in its broadest sense. His added notes from the 1953 edition, all of which are comments, not corrections, imply that he never abandoned these thoughts on metaphysics, despite all of his utterances about a need to overcome it, and their popular interpretations to that effect. In his presentation, he further develops the colorful and intuitive style, an hermeneutic language, that he had created in his earlier work Being and Time. Of human existence he speaks in such expressions as being-there -- ``Dasein" -- and being-in-the-world, the latter term no longer explicit in the 1935 lectures. The lectures can be read as a pre-scientific analysis of how man, being-there, perceives his environment, artfully managing to deal with the manifold challenges posed by the phenomenal structures of the universe. Man attentively recognizes and deciphers their pre-linguistic contents and, while trying to make sense of it all, puts into words his awareness. There are numerous passages in Heidegger's work where he in fairly concrete terms provides us with hints for a perceptive science that, as it turns out and is demonstrated below in this essay, can be explained in terms of recent advances in neuroscience. It would be implausible, even unthinkable, unimaginable, for there not to be found essential agreement between on one hand his philosophical insights gained by hermeneutics of Dasein, into how our brain functions to let us know what's happening & on the other hand, scientific discoveries obtained through anatomy, EEG, fMRI, TMS, electrode implants, etc, of brain structures & functions employed in perception of the momentary scene. A nexus between science and philosophy is provided in Heidegger's definitive treatment of the Logos, here interpreted as a structural version of Platonic forms (Burchard, 2014). This allows for neurolinguistic brain functions to serve as meta-context for Heidegger's being-in-the-world. The logical functions of Dasein's anatomical brain are performed by the logos machine, formerly the human soul, using top-down processing based on a global context, the noumenal cosmos which humans maintain internally. Heidegger's 1942/43 winter semester lectures Parmenides extend in unbroken fashion his 1935 work, proving that he never abandoned, as is widely claimed, his metaphysical avenue of thought. (shrink)

The investigation of the act of Sex protrudes an intricate analysis more so if thus should be justified as an activity of the Mind and not purely physical. This philosophical endeavor investigates on the matter of incorporating Passion in the assertion of Sex as such that will beget Pleasure. In order for the proper direction setting of this inquest, the opus posited a literature review that is akin to the variables of this research. It is therefore qualifiable to assert the (...) variables of Passion, Sex, and Pleasure. As such, these properties allow the rudiments which shall be tackled on the explication. The researcher delved on the investigation on anatomizing Sex and even the Passions involve for it to be protruded in a state that is occupied by the Mind. The very purpose of the opus is to intricately expose the inner workings of the activities that ought to be done in banality. There is also an explication of thought experiments to highlight the integration to the epistemological property of the variable exposed in this endeavor. In the canopy of this research, the highlight is on the ontological property of the faculties ascertained and the epistemological qualification of the properties that are seemingly isolated from the Mind. It is therefore, phenomenological since it protrudes the nature of the properties as they exist in the current circumstance, as such it is less existential simply because what it ascertains is the circumstance upon which the action attributes itself to. -/- . (shrink)

The notion of “hierarchy” is one of the most commonly posited organizational principles in systems neuroscience. To this date, however, it has received little philosophical analysis. This is unfortunate, because the general concept of hierarchy ranges over two approaches with distinct empirical commitments, and whose conceptual relations remain unclear. We call the first approach the “representational hierarchy” view, which posits that an anatomical hierarchy of feed-forward, feed-back, and lateral connections underlies a signal processing hierarchy of input-output relations. Because the representational (...) hierarchy view holds that unimodal sensory representations are subsequently elaborated into more categorical and rule-based ones, it is committed to an increasing degree of abstraction along the hierarchy. The second view, which we call “topological hierarchy", is not committed to different representational functions or degrees of abstraction at different levels. Topological approaches instead posit that the hierarchical level of a part of the brain depends on how central it is to the pattern of connections in the system. Based on the current evidence, we argue that three conceptual relations between the two approaches are possible: topological hierarchies could substantiate the traditional representational hierarchy, conflict with it, or contribute to a plurality of approaches needed to understand the organization of the brain. By articulating each of these possibilities, our analysis attempts to open a conceptual space in which further neuroscientific and philosophical reasoning about neural hierarchy can proceed. (shrink)

Cushman, Young, & Greene (2010) urge the consolidation of moral psychology around a dual-system consensus. On this view, a slow, often-overstretched rational system tends to produce consequentialist intuitions and action-tendencies, while a fast, affective system produces virtuous (or vicious) intuitions and action-tendencies that perform well in their habituated ecological niche but sometimes disastrously outside of it. This perspective suggests a habit-corrected-by-reason picture of moral behavior. Recent research, however, has raised questions about the adequacy of dual-process theories of cognition and behavior, (...) which tend to distinguish categorically between fast, affect-laden, automatic, sometimes-unconscious, nearly-incorrigible mental processes and slow, rational, effortful, conscious, corrigible mental processes. Processes of one alleged type often have properties associated with the contrary type. For instance, rational processes can be emotional, and fast thinking can perform logical operations. In addition, the fast-slow binary transforms a continuous temporal scale into a dichotomous one, losing potentially important information along the way. While these problems are beginning to be addressed in some subfields of psychology, moral psychology has yet to grapple with them. In this theoretical paper, we argue that moral psychology needs a framework that accounts for our knowledge of both temporal and spatial (anatomical) dimensions of the brain basis of moral cognition and virtuous decision-making. We argue that methodologies with very fine-grained temporal granularity, such as electroencephalography (EEG), should be used to complement more frequently used methodologies such as functional magnetic resonance imaging (fMRI). We outline how this might be accomplished using generosity, gratitude, and integrity as a case study. (shrink)

GAMETOGÊNESE -/- Emanuel Isaque Cordeiro da Silva Instituto Agronômico de Pernambuco Departamento de Zootecnia – UFRPE Embrapa Semiárido -/- • _____OBJETIVO -/- Os estudantes bem informados, estão a buscando conhecimento a todo momento. O estudante de Veterinária e Zootecnia, sabe que a Reprodução é uma área de primordial importância para sua carreira. Logo, o conhecimento da mesma torna-se indispensável. No primeiro trabalho da série fisiologia reprodutiva dos animais domésticos, foi abordado de forma clara, didática e objetiva os mecanismos de diferenciação (...) sexual dos embriões em desenvolvimento, quais os genes envolvidos nesse processo e tudo mais. Nesse segundo trabalho, a abordagem será teórica, mas também clara, sobre a formação primordial dos gametas femininos e masculinos, através da ovogênese nas fêmeas e a espermatogênese nos machos. Esse trabalho visa levar a importância do processo de formação dos gametas e a produção hormonal das gônadas, bem como o entendimento sobre as interações com o eixo hipotálamo-hipofisário. -/- •____INTRODUÇÃO -/- A reprodução sexual é um processo mediante a qual dois organismos da mesma espécie unem seu material genético para dar lugar a um organismo fixo com combinação única de genes; para isso, cada organismo produz células que contém a metade do material genético característico da espécie. Essas células haploides (1n) são denominadas gametas; ao combinar-se um gameta masculino com um feminino produz-se uma célula diploide (2n) (zigoto ou ovo) a partir da qual se forma o embrião. A grande maioria das espécies com reprodução sexual são anisogâmicas, o que significa que produzem dois tipos de gametas diferentes: os gametas masculinos são microscópios, móveis e produzem-se em grande quantidade, enquanto que os femininos são grandes, imóveis e produzem-se em menor quantidade. O tipo de gameta que um indivíduo produz é o que define seu sexo; sobre os animais o macho é o indivíduo que produz grandes quantidades de espermatozoides e a fêmea produz uma menor quantidade de óvulos, enquanto que nas plantas as gônadas masculinas são as produtoras pólen e as femininas produzem oosferas. Os gametas são diferentes do resto das células do organismo, as quais se chamam células somáticas; essas últimas são diploides porque contém dois pares de cromossomos, um par herdado do pai do indivíduo e o outro da mãe. As células somáticas, ademais, se dividem por mitose, ao qual os cromossomos se duplicam antes de cada divisão celular e cada uma das células filhas recebe um complemento diploide idêntico dos cromossomos, logo todas as células somáticas de um indivíduo possuem o mesmo material genético, embora cada tipo celular expresse diferentes combinações de genes. Em contraponto, os gametas são células haploides porque possuem somente um par de cromossomos e a metade do material genético característico da espécie. Cada um dos cromossomos em um gameta é resultado da recombinação dos genes contidos nos cromossomos paterno e materno do indivíduo que originam o gameta, e cada um destes possuem uma combinação única de genes. Os gametas se formam a partir das células germinais, que são células que em sua origem são diploides e elas de “comprometem” a manter-se como uma linha celular especial que em determinado momento sofrerá o processo de meiose para dar origem aos gametas haploides, sejam óvulos ou espermatozoides segundo o sexo do animal. Como descrito no trabalho sobre a diferenciação sexual, as células germinativas primordiais originam-se no epiblasto do embrião, e migram desde o saco vitelino até colonizar as cristas gonodais, onde, por sua vez, proliferam-se e se organizam junto com as células somáticas da gônada primitiva para formar o testículo ou o ovário. As células germinais masculinas e femininas tem a mesma origem embrionária. As gônadas indiferenciadas em um embrião possuem três tipos celulares: as células que dão origem aos gametas (ovogonia ou espermatogonia), as precursoras de células que nutrem os gametas em desenvolvimento (células da granulosa no ovário; células de Sertoli no testículo) e as precursoras de células que secretam hormônios sexuais (células da teca no ovário; células de Leydig no testículo). As células germinais são as únicas estruturas do organismo que têm a capacidade de dividir-se por meiose sofrendo uma redução no número de seus cromossomos, sendo responsável pela transmissão da carga genética aos descendentes. Em contraste, as células somáticas somente se dividem por mitose. A formação dos gametas compreende fases sequenciais de mitose, meiose e pós-meiose. Esses processos são altamente organizados e necessitam de um preciso e bem coordenado programa de expressão genética. Uma das características importantes da gametogênese é a redução cromossômica, que através da meiose, reduz pela metade o número de cromossomos e produz células distintas entre si, devido a trocas de material genético entre os pares de cromossomos provenientes do pai e da mãe, o que ocorre no processo de “crossing over” durante a primeira fase da meiose. A gametogênese é o processo mediante o qual as células germinais de cada sexo se multiplicam, dividem e diferenciam até formar os gametas. No caso da formação dos gametas masculinos o processo recebe o nome específico de espermatogênese, e para os gametas femininos é denominado como ovogênese. Embora os dois processos alcancem o objetivo comum de produção das células haploides, por onde compartilham algumas características, existem diferenças marcadas entre eles devido a necessidade de produzir um número muito distinto de gametas, de tamanho diferente, e com características de motilidade também distintas. -/- •___ESPERMATOGÊNESE -/- A espermatogênese é o processo mediante o qual se produz os gametas masculinos denominados espermatozoides. Durante a vida fetal as células germinais e as células somáticas do testículo em formação organizam-se em túbulos seminíferos que se derivam dos cordões sexuais primários e conformam a maior parte da medula do testículo. Na etapa fetal cada tubo seminífero é delimitado por uma membrana basal, recoberta na parte interior pelas células precursoras das células de Sertoli (um tipo de células somáticas). No exterior do túbulo localizam-se as células precursoras das células de Leydig ou intersticiais (figura 1), que também são células somáticas. Entre a membrana basal e as células de Sertoli encontram-se algumas células germinais denominadas espermatogonias de reserva A0 (denominadas gonócitos) que serão o único tipo de células germinais presentes no testículo enquanto o animal não alcançar a puberdade. As células de Sertoli estabelecem na região basal uniões oclusoras entre si, formando parte da barreira hemato-testicular. As espermatogonias A0 localizam-se por dentro da membrana basal do túbulo seminífero, embora fora da barreira hemato-testicular. Figura 1: fase neonatal. Nota-se a grande infiltração de tecido intersticial em quase 50% da seção originando que os túbulos sejam pequenos e redondos em sua maioria. O citoplasma e núcleo das células pré-Leydig são notadas claramente por essa ser uma espécie suína onde o tecido intersticial está claramente diferenciado. Hematoxilina-eosina (X 220.5). Fonte: Embrapa. -/- O número de células de Sertoli no testículo depende da influência do hormônio folículo estimulante (FSH) presente durante a vida fetal e as primeiras etapas de vida pós-natal. A população de células de Sertoli ao chegar a puberdade se manterá fixa durante o resto da vida do animal; existe uma relação positiva entre o tamanho e a população de células de Sertoli e a capacidade de produção de espermatozoides do testículo. As células de Sertoli são as únicas células somáticas que estão no epitélio seminífero, e sua função é a nutrição, sustentação e controle endócrino das células germinais. As células de Sertoli participam ativamente no processo de liberação dos espermatozoides para a luz do túbulo. Nesse momento, as células de Sertoli realizam a fagocitose de parte do citoplasma do espermatozoide dos chamados corpos residuais. As células de Sertoli também fagocitam as células germinais que se degeneram no curso normal da espermatogênese. Essas células ainda sintetizam grande quantidade de proteínas, como por exemplo as proteínas ABP (androgen hinding protein), que transportam andrógenos para todo o aparelho reprodutivo, transferrinas, que transportam ferro para a respiração celular das células germinais e também às inibinas, que regulam a liberação de FSH pela hipófise, através de um sistema de retroalimentação (feedback) negativa (figura 2). Figura 2: epitélio seminífero, células de Sertoli (flecha) (400 X). Fonte: Embrapa. -/- Antes da puberdade dos túbulos seminíferos observam-se ao corte como estruturas de diâmetro pequeno, sem luz, e conformados unicamente pelas células de Sertoli e espermatogonias de reserva e rodeados por abundante tecido intersticial, ao que estão presentes as células precursoras das células de Leydig. Ainda antes da puberdade, a diferenciação celular manifesta-se primeiro pela presença de espermatócitos primários, os quais se degeneram em geral na fase de paquíteno, por falta de estimulação hormonal. A partir de que o animal chega a puberdade inicia-se o processo de espermatogênese, que se manterá durante toda a vida do animal, exceto em espécies de animais silvestres muito estacionais, ao qual pode se suspender durante a época não reprodutiva para voltar e ser retomada na época ou estação reprodutiva. Depois da puberdade, os túbulos seminíferos possuem um diâmetro muito maior; em seu interior observa-se um grande número de células germinais de todos os tipos, diferentes estádios de divisão, e em seu lúmen contém líquido e espermatozoides. Ainda sobre o alcancei da puberdade, as espermatogonias começam a dividir-se aceleradamente por mitose, enquanto que no espaço intersticial as células mesenquimais também começam a se diferenciar e a dar origem as células de Leydig (figura 3). A partir dessa etapa as células de Leydig (totalmente diferenciadas) são também evidentes no exterior do túbulo, junto com as células mioides ou peritubulares que o rodeiam o que ao contrair-se são responsáveis por controlar o avanço dos fluidos e as células presentes no lúmen do túbulo. As células mioides estão situadas ao redor do túbulo, e é creditado a elas a promoção da contração e da integridade estrutural do túbulo. Esse tipo celular apenas se diferencia na puberdade pela ação dos andrógenos (figura 4). As interações entre as células de Sertoli e as mioides parecem ter um papel importante na manutenção das funções do testículo. Durante o processo de espermatogênese, as espermatogonias de reserva dividem-se periodicamente e enquanto algumas células fixas permanecem como espermatogonias de reserva, outras proliferam e sofrem uma seção de divisões mitóticas durante as quais se vão diferenciando até formarem espermatócitos primários (espermatocitogênese ou fase de mitose), logo sofrem divisões especiais mediante as quais reduzem seu número de cromossomos (fase de meiose), e ao final trocam de forma para converter-se em espermatozoides (espermatocitogênese) (figura 5). Cada uma dessas etapas da espermato- gênese será descrito detalhadamente adiante, antes é necessário a explicação de algumas características das células de Sertoli e de Leydig que ajudarão a entender seu papel durante a espermatogênese. Figura 3: células de Leydig no espaço intersticial do testículo bovino adulto PAS (400 X). Fonte: Embrapa. -/- Figura 4: o estabelecimento da puberdade pela presença de espermatozoides no túbulo. Hematoxilina-eosina (400 X). Fonte: Embrapa. Figura 5: fases mitóticas das espermatogonias (A0 e B) para formação de um espermatócito primário e as duas fases de meiose que se sucedem antes da espermatogênese. Fonte: ZARCO, 2018. -/- Ao início da espermatocitogênese as uniões oclusoras entre as células de Sertoli se abrem por etapas (como as comportas de um submarino) para permitir a passagem das espermatogonias em direção ao centro do túbulo seminífero sem que se estabeleça uma continuidade entre o exterior e o interior da barreira hemato-testicular. Uma vez ultrapassada essa barreira, as sucessivas gerações de espermatogonias, espermatócitos, espermátides e espermatozoides irão se localizar em direção ao interior do túbulo seminífero, em estreita associação com as células de Sertoli. Em consequência, as células de Sertoli dividem o túbulo seminífero em dois compartimentos; o compartimento basal (debaixo das uniões oclusoras das células de Sertoli), ao qual residem as espermatogonias de reserva, e o compartimento adluminal (em direção ao centro do túbulo), cujos espaços entre as células de Sertoli desenvolvem o resto do processo de espermatogênese (meiose e espermatocitogênese). Esse feito é importante porque durante a vida fetal as únicas células germinais existentes eram as espermatogonias de reserva, pelo que os antígenos expressados por gerações mais avançadas (espermatogonias intermediárias, secundárias, espermátides e espermatozoides) não são reconhecidos como próprios do corpo pelo sistema imunológico. Logo, o anterior implica que deve existir uma barreira entre eles e o sangue para evitar um ataque imunológico. Em todas as etapas da espermatogênese, as células de Sertoli atuam como células de suporte para as células germinais, que sempre permanecem recoberta pela membrana das células de Sertoli. Também atuam como células nutricionais já que proporcionam o meio em que as células germinais se desenvolvem e maturam, assim como as substâncias que regulam e sincronizam as sucessivas divisões e transformações das células germinais. As células de Sertoli produzem hormônios, como estrógenos e inibina que atuam sobre a hipófise para regular a secreção das gonadotropinas que controlam a espermatogênese. As células de Leydig que residem no exterior do túbulo seminífero também são importantes para a espermatogênese: produzem a testosterona que estimula e mantém a espermatogênese, bem como serve como substrato sobre o qual atua como aromatizador das células de Sertoli para transformá-las em estrógenos. Como supracitado, para seu estudo podemos dividir a espermatogênese em três fase: espermatocitogênese, meiose e espermiogênese (figura 6). Agora, serão descritas cada uma dessas etapas. Em algumas espécies, incluindo no homem, os macrófagos representam o segundo tipo celular intersticial mais numeroso no testículo, depois das células de Leydig. Os macrófagos e vários subtipos de linfócitos são identificados nós testículos de ovinos e ratos. Eles estão intimamente associados com as células de Leydig e atuam juntamente na regulação da esteroidogênese. Figura 6: fluxograma da espermatogênese. -/- Espermatocitogênese -/- A espermatocitogênese, também chamada de etapa proliferativa ou de mitose, consiste numa série de divisões mitóticas sofridas pelas células descendentes de uma espermatogonia de reserva. Uma vez que a célula se divide, abandona o estado de reserva e começa um processo de diferenciação. As espermatogonias de reserva (denominadas espermatogonias A0 na rata ou As nos humanos) são células que existem desde a vida fetal e que permanecem mitoticamente inativas durante a infância. Uma vez que alcançam a puberdade começam a dividir-se em intervalos regulares, e as células filhas podem permanecer como espermatogonias de reserva ou abandonar a reserva e ingressar na dita espermatocitogênese. Uma vez abandonada a reserva, as células filhas que vão se formando em cada divisão permanecem unidas por pontes citoplasmáticas, constituindo um clone que se divide sincronicamente. As células que se formam depois de cada divisão continuam sendo espermatogonias, porém cada geração é ligeiramente diferente da anterior. Na rata, por exemplo, as espermatogonias tipo A0 ao dividir-se originam espermatogonias do tipo A1, que em sucessivas divisões formam espermatogonias dos tipos A2, A3 e A4, as quais, por sua vez, sofrem outra mitose para formar espermatogonias intermediárias e uma mais para formar espermatogonias do tipo B. Essas últimas se diferenciam (sem se dividir) em espermatócitos primários, processo em que termina a fase de espermatocitogênese, que literalmente significa processo de geração de espermatócitos. As espermatogonias tipo A0 são a fonte para a contínua produção de gametas. A metade delas se dividem e formam células iguais (as chamadas células tronco) e a outra metade forma as espermatogonias A1, que sofre novas divisões mitóticas e formam os tipos 2, 3 e 4. O tipo A4 sofre mitose para formar a intermediária (A In), que por mitose, forma a tipo B (figura 6). Esses tipos de espermatogonias podem ser identificadas em evoluções histológicas de acordo com sua organização topográfica na membrana basal dos túbulos seminíferos ou mediante seu conteúdo de heterocromatina. Outra maneira de diferenciação se baseia em marcadores moleculares específicos que distinguem as espermatogonias tronco (A0) das demais, com os fins de isolamento, desenvolvimento in vitro e transplante. As tipo B passam por mitose para formarem os espermatócitos primários; estes iniciam a primeira etapa da meiose formando os espermatócitos secundários; na segunda etapa da divisão meiótica, cada espermatócito secundário se divide e formam as chamadas espermátides. Quando o testículo alcança seu desenvolvimento total, a meiose completa-se e as espermátides originadas se convertem em espermatozoides. Um dos maiores sinais característicos desse fenômeno é o alargamento das espermátides e sua migração em direção ao lúmen do túbulo seminífero (figuras 4, 7 e 8). Figura 7: espermatogonias marcadas por imuno-histoquímica, anticorpo monoclonal TGFa (400 x). Figura 8: fases de divisões meióticas (M), espermatócitos em paquíteno (PA) e espermatócitos secundários (ES). -/- Figura 9: estádio posterior a liberação dos espermatozoides na luz do túbulo. Hematoxilina-eosina (400 x). Mediante as seis divisões mitóticas que ocorrem durante a espermatocitogênese se forma potencialmente um clone de 64 espermatócitos primários a partir de cada espermatogonia A que ingressa sobre o processo. Não obstante, algumas células sofrem apoptose em cada uma das etapas do processo, ao qual o número real formado é menor. Em outras espécies produzem-se um transcurso similar de divisões mitóticas sucessivas durante a espermatocitogênese, embora a nomenclatura utilizada possa ser distinta, por exemplo nos bovinos as duas últimas divisões mitóticas dão origem as espermatogonias de tipo B1 e B2. -/- Meiose -/- Uma vez que as espermatogonias B se diferenciam em espermatócitos primários, esses iniciam a etapa de meiose, com uma nova divisão; desta vez a divisão é do tipo meiótica. Ao completar-se a primeira divisão meiótica (meiose I) se obtém os espermató-citos secundários, que ao sofrer a segunda divisão meiótica (meiose II) dão origem as espermátides. Vale salientar que a meiose é o processo mediante o qual reduz-se a metade do número de cromossomos, pelo que as espermátides que se obtém são células haploides (1n). Os espermatócitos secundários que se formam depois da primeira divisão meiótica contém a metade do número normal de cromossomos, porém a mesma quantidade de DNA já que cada cromossomo é duplo. As espermátides formadas na conclusão da segunda divisão meiótica (figura 7), por sua vez, contém a metade dos cromossomos, e esse já não são duplos, já que se trata de células 1n. Também deve-se enfatizar que durante a meiose é relevante o entrecruzamento dos cromossomos homólogos, pelo que cada espermátide possui uma combinação única e diferente de genes paternos e maternos. Outro ponto que deve ser levado em consideração é que cada espermátide somente possui um cromossomo sexual; a metade das espermátides contém o cromossomo X herdado da mãe do macho que está levando a cabo a espermatogênese e a outra metade contém o cromossomo Y herdado de seu pai. Para cada espermatócito primário que entra no processo de meiose obtém-se cerca de quatro espermátides, pelo qual ao ser completada a meiose potencialmente se poderiam formar até 256 espermátides por cada espermatogonia que abandona a reserva e ingressa na espermatocitogênese. -/- Espermiogênese -/- Durante a espermiogênese, também chamada de fase de diferenciação, as esper-mátides sofrem, sem se dividir, uma metamorfose que as transforma em espermatozoides, os quais finalmente são liberados das células de Sertoli em direção ao lúmen do túbulo seminífero. A espermiogênese é um processo complicado e longo já que a espermátide deve sofrer complexas trocas nucleares, citoplasmáticas e morfológicas que resultam na forma-ção dos espermatozoides. Algumas dessas mudanças incluem a condensação do material nuclear para formação de um núcleo plano e denso, a eliminação do citoplasma para a constituição de uma célula pequena, a formação de uma estrutura especializada denomi-nada acrossomo ou tampa cefálica, e a formação do pescoço e da cauda (flagelo) do esper-matozoide, do que depende a sua motilidade. Durante a maior parte da espermiogênese, as espermátides se mantém com uma estreita associação com as células de Sertoli; logo, chega-se a observar, então, flagelos que se projetam em direção a luz do túbulo que pare-cem sair das células de Sertoli, sendo na realidade os flagelos dos espermatozoides que ainda não tinham sido liberados pelo lúmen. Ao liberar os espermatozoides em direção a luz do túbulo, as células de Sertoli realizam a fagocitose de parte do citoplasma dos espermatozoides (corpos residuais). Também fagocitam os restos de todas as células germinais que sofrem apoptose ou degeneram-se durante a espermatogênese. Credita-se que ao realizar essas funções as células de Sertoli podem fazer uma monitoração eficiente da espermatogênese, o que lhes permitiria emitir sinais para colaborar na regulação desse processo em nível gonodal e a nível sistêmico através da secreção de hormônios como a inibina e o estradiol. Além da inibina e activina, as células de Sertoli sintetizam outras proteínas, como a ABP (proteína ligadora de andrógenos) que serve como uma molécula de transporte de andrógenos dentro dos túbulos seminíferos, ductos deferentes e epidídimo, ou a transfer-rina, que transporta o ferro necessário para a respiração celular. -/- Resultados da espermatogênese -/- O resultado da espermatogênese não significa apenas uma simples multiplicação das células germinais (até 256 espermatozoides a partir de cada espermatogonia A1), senão que através dela são produzidos gametas haploides pequenos, móveis e com grande diversidade genética entre eles, ao mesmo tempo que se mantêm uma reversa de células mãe (espermatogonias A0) a partir das quais se poderiam originar novos ciclos de esper-matogênese durante o resto da vida do animal. -/- Controle hormonal da espermatogênese -/- Como mencionado, o FSH reproduz um importante papel para o estabelecimento das células de Sertoli durante a vida fetal e início da vida pós-natal. O começo da esper-matogênese também é estimulado pelo FSH, que atua sobre as células de Sertoli para estimular sua função e a ativação de sinais dessas células em direção as células germinais, incluindo-as a abandonar a reserva e ingressar na espermatogênese. O FSH, assim mesmo, estimula a mitose durante o resto da espermatogênese e aumenta a eficiência do processo, já que reduz a apoptose e a degeneração de espermatogonias intermediárias e do tipo B. O FSH também estimula as células de Sertoli para produzirem inibina e ABP. Uma vez iniciada a espermatogênese somente requerem níveis baixos de FSH para se mantê-la. As células de Sertoli também devem ser estimuladas pela testosterona para funcio-nar de maneira adequada; se requer também do LH hipofisário: hormônio que estimula as células de Leydig para produzir testosterona. Por sua vez, a secreção de LH e FSH é regulada pelo GnRH hipotalâmico: esse neurohormônio também faz parte do mecanismo de regulação da espermatogênese. A espermatogênese também é modulada em nível local mediante a produção de determinados fatores e interações entre as células. Dentro dos fatores locais podemos mencionar o fator de crescimento parecido com a insulina 1 (IGF-1), o fator de crescimen-to transformante beta (TGF- β), activina, ocitocina e diversas citocinas. Entre as intera-ções celulares existem tanto uniões de comunicação entre as células de Sertoli e as células germinais, como pontes citoplasmáticas entre todas as células germinais que formam o clone de células descendentes de uma espermatogonia A1. Uma vez que as células de Sertoli iniciam sua função na puberdade é possível manter experimentalmente a espermatogênese somente com testosterona, sem ser requeri-dos nenhum outro hormônio. A quantidade de espermatozoides produzidos, no entanto, é maior quando há presença do FSH. Abaixo do estímulo do FSH as células de Sertoli produzem estradiol e inibina, hormônios que geram uma retroalimentação sobre o eixo hipotálamo-hipofisário para a regulação da secreção de gonadotropinas. Em particular, a inibina reduz a secreção de FSH, pelo qual é factível que sirva como um sinal que evite uma excessiva estimulação as células de Sertoli. -/- Ciclo do epitélio seminífero -/- Em cada espécie as espermatogonias de reserva iniciam um novo processo de divi-sões celulares em intervalos fixos: a casa 14 dias no touro; 12 dias no garanhão e a cada 9 dias no cachaço (reprodutor suíno). A nova geração de células que começam a proliferar sobre a base do tubo deslocam-se em direção ao centro do túbulo a geração anterior, que por sua vez deslocam-se as gerações anteriores. Devido as mudanças que vão sofrendo cada geração celular se ajustam a tempos característicos de cada etapa, já que rodas as células em uma determinada seção do túbulo estão sincronizadas entre si pelas células de Sertoli; em cada espécie somente é possível encontrar um certo número de combinações celulares: 14 diferentes combinações no caso da rata, 8 no touro e 6 no ser humano. A sucessão de possíveis combinações até regressar a primeira combinação se conhece como o ciclo do epitélio seminífero. Na maioria das espécies os espermatozoides que são libera-dos em direção a luz do túbulo provém das células que entraram no processo de esperma-togênese quatro gerações antes que a geração que está ingressando nesse momento, pelo que a espermatogênese no touro dura ao redor de 60 dias e um pouco menos em outras espécies domésticas. Significa que os efeitos negativos das alterações na espermatogêne-se podem estar presentes até dois meses depois de que se produziram essas alterações. Como supracitado, geralmente se observa a mesma combinação celular em toda a área de uma determinada secção transversal do túbulo seminífero. No entanto, se fizermos uma série de secções, observa-se que ao longo do túbulo há uma sucessão ordenada de combinações (a primeira em uma determinada secção; a segunda combinação na seguinte secção, e assim sucessivamente em secções subsequentes até regressar a primeira combi-nação. Teremos, então, que ao início da divisão das espermatogonias A1 se produz de forma sincronizada em uma secção do túbulo, e vai-se transmitindo como uma onda peristáltica as secções adjacentes. Esse processo é denominado como onda do epitélio seminífero e graças à esse túbulo seminífero sempre tem secções em todas as etapas da espermatogênese, com o que se alcança uma produção constante de espermatozoides. -/- Alterações da espermatogênese -/- Nas espécies estacionais a espermatogênese, como já mencionado, pode reduzir-se ou inclusive suspender sua atividade fisiológica durante a época não reprodutiva dessas espécimes, porém esse processo fisiológico não pode ser considerado como uma altera-ção. No entanto, a espermatogênese só pode ser alterada pelas enfermidades ou por fatores externos. A principal causa de alterações na espermatogênese é o aumento da temperatura testicular. Por isso, os testículos são localizados na saco escrotal e são “caídos” para fora do corpo como pode-se observar nos bovinos, caprinos, ovinos, caninos e no próprio homem. A temperatura testicular deve estar cerca de 2 a 6 °C abaixo da temperatura corporal normal. As células germinais masculinas são sensíveis ao calor, pelo qual na maioria dos mamíferos os testículos se encontram fora da cavidade abdominal e existe um sofisticado sistema de termorregulação para mantê-los a uma temperatura menor que a corporal. Se a temperatura corporal for elevada ou se os testículos permanecerem na cavidade abdominal, ou ainda se os sistemas termorreguladores do testículo sejam afetados por fatores inflamatórios como edema ou falta de mobilidade testicular dentro do escroto, a temperatura do tecido testicular aumentará e a espermatogênese sofrerá alterações proporcionais ao excesso de temperatura e a duração da elevação. A espermatogênese também pode ser afetada pela exposição a hormônios ou a outras substâncias. É possível que a causa mais comum (sobretudo no homem) seja o uso de esteroides anabólicos, que elevam a concentração de andrógenos na circulação, provo-cando um feedback negativo sobre a secreção de gonadotropinas. Ao deixar de estimular-se o testículo pelas gonadotropinas, este deixará de produzir testosterona, e as concentra-ções de andrógeno exógeno nunca alcançará as altíssimas concentrações de testosterona que normalmente estão presentes a nível do tecido testicular por ser o local onde se produz o hormônio. Também se supõe que diversas substâncias com propriedades estrogênicas derivadas de processos industriais (indústria dos plásticos, hidrocarbonetos etc.) e presentes no ambiente (fatores xenobióticos) podem ser responsáveis pelas alterações na espermatogênese em diversas espécies, entre as quais se inclui o ser humano. -/- • OVOGÊNESE E FOLICULOGÊNESE -/- A ovogênese é o processo seguido pelas células germinais da fêmea para a forma-ção dos óvulos, que são células haploides. Durante a vida fetal as células germinais proliferam-se no ovário por mitose, formando um grande número de ovogonias, algumas das quais se diferenciam em ovócitos primários que iniciam sua primeira divisão meiótica para deter-se na prófase da divisão. Somente alguns desses ovócitos primários retornarão e concluirão a primeira divisão meiótica em algum momento da vida adulta do animal, dando origem a um ovócito secundário e a um corpo polar. O ovócito secundário inicia a sua segunda divisão meiótica, a qual volta a ficar suspensa até receber um estímulo apropriado, já que somente os ovócitos secundários que são ovulados e penetrados por um espermatozoide retornam e concluem a segunda divisão meiótica, dando origem a um óvulo (figura 10). O processo de ovogênese é realizado dentro dos folículos ovarianos, que também tem que sofrer um longo transcurso de desenvolvimento e diferenciação denominado foliculogênese pelo que a ovogênese como tal realiza-se dentro do marco desse último processo. Por essa razão, na seguinte seção descreverei tanto a ovogênese como a folicu-logênese, e a relação que existe entre ambos. Figura 10: representação da ovogênese. Na etapa de proliferação, as células germinais se diferen-ciam por mitose. A meiose I se caracteriza por uma prófase prolongada, ocorrendo a duplicação do DNA. Nas duas divisões, que ocorrem antes da ovulação e depois da fertilização, a quantidade de DNA é reduzida a 1n, com o fim de que a fusão dos pronúcles (singamia) pós-fertilização, seja gerado um zigoto com um número de cromossomos de 2n (diploide). -/- Geração de ovócitos primários e folículos primordiais Tanto a ovogênese como a foliculogênese iniciam-se durante a vida fetal, quando as células germinais primordiais provenientes do saco vitelino colonizam a gônada primitiva e, junto com as células somáticas z organizam-se para a formação dos cordões sexuais secundários, que se desenvolvem principalmente no córtex do ovário. Nesse período, as células germinais que colonizaram o ovário sofrem até 30 divisões mitóticas, proliferando-se até formar milhares ou milhões de ovogonias, que inicialmente formam “ninhos” constituídos cada um deles por um clone de várias ovogonias que descendem da mesma célula precursora e que se mantêm unidas por pontes citoplasmáticas, sincronizan-do suas divisões mitóticas. Nessa etapa alcança-se a máxima população de células germinais no ovário, que antes de nascer se reduzirá drasticamente por apoptose. No ovário do feto humano chegam a haver até sete milhões de células germinais que ao nascimento se reduzem a dois milhões. Os ovários fetais do bovino, de maneira análoga, chegam a ter até 2.100.000 células germinais, que ao nascimento reduzem para 130.000 aproximadamente. A redução no número de ovogonias produz-se ao mesmo tempo que essas células, que vêm dividindo-se por mitose e estão agrupadas em ninhos, iniciam sua primeira divisão meiótica para se transformarem em ovócitos primários: células germinais que se encontram em uma etapa de suspensão (diplóteno) da prófase da primeira divisão meiótica. Nesse período produz-se uma grande proporção de células germinais; as células somáticas dos cordões sexuais, por sua vez, emitem projeções citoplasmáticas que separam a isolam os ovócitos primários sobreviventes, ficando cada um deles rodeados por uma capa de células aplanadas da (pré) granulosa. Ao mesmo tempo em que se forma uma membrana basal entre as células da granulosa e o tecido intersticial do ovário. Ao ovócito primário rodeado de uma capa de células da (pré) granulosa aplanadas e delimita-das por uma membrana basal denomina-se de folículo primordial (figura 11). Nas vacas os folículos primordiais bem formados já estão presentes nos ovários a partir do dia 90 da gestação. A maioria dos folículos primordiais com os que nasce uma fêmea se manterão inativos durante um longo tempo; muitos deles durante toda a vida do animal. Nos folículos primordiais inativos tanto os ovócitos primários como as células da granulosa conservam sua forma original e mantém um metabolismo reduzido estritamente ao mínimo necessário para manter-se viáveis. Por essa razão, ao realizar um corte histológico de qualquer ovário as estruturas mais numerosas que se observam serão os folículos primordiais. No entanto, cada dia da vida de um animal, inclusive desde a vida fetal, um certo número de folículos primordiais reiniciam seu desenvolvimento, e a partir desse momento um folículo exclusivamente pode ter dois destinos: o primeiro, prosseguir seu desenvolvi-mento até chegar a ovular, e o segundo (que é muito mais frequente) encontrar em algum momento condições inadequadas que fazem fronteira com ele para parar seu desenvolvi-mento, levando-o a sofrer atresia e degenerar até desaparecer do ovário. Figura 11: sequência da foliculogênese apresentando as diferentes estruturas que podemos encontrar em cada fase. Fonte: ZARCO, 2018. Culminação da ovogênese A ovogênese somente se completará quando um ovócito primário reinicia a meio-se; completa sua primeira divisão meiótica para formar um ovócito secundário e um primeiro corpo polar e, quando, finalmente sofrer uma segunda divisão meiótica para formar um óvulo e um segundo corpo polar. Os óvulos são as células 1n que constituem os gametas femininos, pouco numerosos, grandes e imóveis. A grande maioria dos ovóci-tos primários, como veremos mais adiante, nunca retomam a meiose e, em consequência, não chegam a formar ovócitos secundários, e muitos dos ovócitos secundários tampouco sofrem uma segunda divisão meiótica, pelo que não chegam a formar os óvulos. Ao longo da vida de uma fêmea, na maioria das espécies, menos de 0,1% dos ovócitos primários (um a cada mil) chega a terminar a ovogênese, dando origem a um óvulo. O supracitado deve-se a que a ovogênese somente pode retomar-se e ser completa-da em ovócitos primários que se encontram dentro dos folículos primordiais que (uma vez ativados) vão alcançando diversas etapas de seu desenvolvimento em momentos precisos aos que encontram as condições ideais de oxigenação, nutrição, vascularização e exposição a fatores parácrinos e a exposição a concentrações de hormônios que se requerem para que o folículo continue em cada etapa de seu desenvolvimento com o processo de foliculogênese até chegar a ovular. Qualquer folículo que não esteja nessas condições ao longo do desenvolvimento sofrerá degeneração e atresia, pelo que o ovócito primário em seu interior nunca chegará ao ponto em que pode retomar a primeira divisão meiótica. No que resta da presente seção revisaremos o processo de foliculogênese em cujo marco se desenvolve a ovogênese; havemos que tomar de conta que essa última se limita ao que ocorre nas células germinais (ovogonia, ovócito primário, secundário e óvulo), pelo qual depende intimamente do desenvolvimento do folículo de que essas células formam parte. Em um princípio a ativação do folículo primordial e o desenvolvimento folicular são independentes das gonadotropinas: não se conhecem os mecanismos precisos median-te os quais um folículo primordial se ativa e reinicia seu desenvolvimento, nem como se decide quais folículos, dentre as dezenas de milhares de ou centenas de milhares presentes em um ovário se reativarão em um dia em particular. A reativação trata-se de uma liberação de influência de fatores inibidores, já que os folículos primordiais se reativam espontaneamente quando cultivados in vitro, isolados do resto do tecido ovariano. Uma vez que um folículo primordial se ativa, inicia-se um longo processo de desenvolvimento que somente depois de vários meses (ao redor de cinco meses no caso dos bovinos) o levará a um estádio em que seu desenvolvimento posterior requer a presença das gonado-tropinas; daí que se diz que as primeiras etapas do desenvolvimento são independentes das gonadotropinas. Durante a fase independente de gonadotropinas, um folículo primordial que tenha sido ativado e tenha começado a crescer; passará primeiro para a etapa de folículo primá-rio, caracterizada por conter um ovócito primário que está rodeado, por sua vez, por uma capa de células da granulosa, que não são planas, e sim cúbicas. Depois, se o folículo continuar crescendo se transformará em um folículo secundário, ao qual as células da granulosa começam a proliferar (aumentando em número) e se organizam em duas ou mais capas que rodeiam o ovócito primário. Entre o ovócito e as células da granulosa que o rodeiam se forma nesta uma zona pelúcida; ainda assim o ovócito mantém contato direto com essas células, mediante o estabelecimento de pontes citoplasmáticas que atravessam a zona pelúcida. Através dessas pontes citoplasmáticas as células da granulosa podem passar nutrientes e informação ao ovócito primário. O volume e o diâmetro do ovócito primário aumentam ao mesmo tempo que as células da granulosa proliferam-se, para incrementar as capas ao redor do ovócito. De maneira gradual o citoplasma do ovócito primário aumenta até 50 vezes seu volume e a proliferação das células continua. Esses folículos que possuem cada vez mais células e portanto mais capas de células da granulosa se denominam folículos secundários. Para evitar confusões, há a necessidade de nomen-clatura ao qual o folículo vá mudando de nome de primordial a primário e logo, de secun-dário, a terciário, por sua vez, o ovócito que encontra-se em seu interior, a todo momento, segue sendo um ovócito primário. Durante a etapa dependente de gonadotropinas, os folículos secundários começam a formar um espaço cheio de líquido, o antro folicular, desse modo se convertem em folí-culos terciários. Com a utilização de outra nomenclatura, a formação do antro marca a transição entre folículos pré-antrais (sem antro) e folículos antrais (com antro). Em algum momento dessa transição entre folículo secundário e terciário, também aparece a depen-dência de folículos em direção as gonadotropinas, pelo qual somente podem seguir crescendo na presença do hormônio luteinizante (LH) e do hormônio folículo estimulante (FSH). Nos bovinos e em outras espécies (para seu estudo), os folículos antrais são dividi-dos em pequenos, médios e grandes. Embora todos eles possuam um antro folicular, dependendo do seu grau de desenvolvimento requerem diferentes concentrações de gona-dotropinas para continuar o crescimento. Os folículos antrais mais pequenos somente re-querem concentrações baixas de LH e FSH, pelo qual podem continuar crescendo em qualquer momento do ciclo estral inclusive em animais que não estão ciclando (fêmeas em anestro pré-puberal, gestacional, lactacional, estacional). Nas etapas posteriores os folículos antrais requerem primeiro concentrações elevadas de FSH, e nas etapas finais somente podem continuar crescendo na presença de pulsos frequentes de LH, pelo qual somente os folículos que encontram-se sob concentrações apropriadas desses hormônios podem seguir crescendo. Por essa razão, nos animais que se encontram em anestro de qualquer tipo somente é possível encontrar folículos antrais pequenos ou médios, segundo a espécie, e nos animais que se encontram ciclando (estro) o maior tamanho folicular encontrado em um determinado dia do ciclo dependerá das concentrações de FSH e LH presentes nesse momento e nos dias anteriores. Um folículo que chega ao estado máximo de desenvolvimento, conhecido como folículo pré-ovulatório, ao final, somente chegará a ovular se for exposto a um pico pré-ovulatório de LH. Como supracitado, cada dia na vida de uma fêmea inicia seu desenvolvimento um certo número de folículos; a grande maioria sofrem atresia, mas depois da puberdade em cada dia do ciclo estral um ou vários folículos vão encontrando ao longo do seu desenvol-vimento concentrações hormonais que lhes permite chegar na etapa de folículo pré-ovula-tório. Somente nestes folículos, e como consequência de um pico pré-ovulatório de LH, se reinicia e completa-se a primeira divisão meiótica do ovócito primário, produzindo duas células distintas. Uma delas é o ovócito secundário, que retém praticamente todo o citoplasma. Contém, assim mesmo, em seu núcleo um par de cromossomos duplos, a outra é o primeiro corpo polar, que é exclusivamente um núcleo com uma quantidade mínima de citoplasma. Na maioria das espécies ovula-se um ovócito secundário que se encontra, então, suspendido na segunda divisão meiótica. Esta segunda divisão meiótica somente reinicia-rá e completarar-se uma vez que o espermatozoide começa a penetrar sob o ovócito secundário. Ao concluir-se a divisão se forma o segundo corpo polar e completa-se a ovogênese com o qual se obtém o óvulo, célula 1n que constitui o gameta feminino. No entanto, o óvulo existe pouco tempo como tal, já que em poucos minutos/horas (depen-dendo da espécie) se produzirá a fusão do núcleo do mesmo (pró-núcleo feminino) com o do espermatozoide (pró-núcleo masculino), com o qual se completa a fertilização e se forma um novo indivíduo (o ovo ou zigoto). -/- Ondas foliculares -/- Como mencionado supra, todos os dias um determinado número de folículos pri-mordiais se ativam e começam a crescer, os quais crescem em um ritmo característico em cada espécie. Isso provoca que em qualquer momento existam nos ovários folículos pri-mordiais (que começam a crescer em alguns dias ou semanas), assim como folículos secundários em diversas etapas do desenvolvimento, os quais iniciaram seu desenvolvi-mento em semanas ou inclusive meses (segundo o grau de desenvolvimento atual). Também em qualquer momento poderá haver folículos antrais nas etapas iniciais de seu desenvolvimento (com antros que já se podem detectar em cortes histológicos mas não são visíveis macroscopicamente). Todos esses folículos chegaram até seu estado de de-senvolvimento atual (primário, secundário ou antral pequeno), independente da etapa do ciclo estral em que sejam observados ou encontrados. Nos bovinos, os folículos que chegam ao início da etapa antral iniciaram seu desenvolvimento cinco meses antes, e todavia requerem ao redor de 42 dias para chegar ao estado pré-ovulatório. Para continuar seu desenvolvimento, os folículos antrais pequenos devem encon-trar concentrações altas de FSH, que os estimulam para prosseguir o crescimento. Cada vez que se produz uma elevação nas concentrações de FSH, esse hormônio estimula o desenvolvimento de um grupo de folículos antrais pequenos, que começaram a crescer muito tempo antes e que o dia da elevação de FSH tenha alcançado o grau de desenvolvi-mento preciso para responder com eficiência a este hormônio, o qual atuará através de seus receptores nas células da granulosa para estimular a produção de estradiol, a secreção de inibina, a produção de líquido folicular e a proliferação das células da granulosa. Um grupo de folículos antrais pequenos é assim recrutado pelo FSH para acelerar seu cresci-mento e aumentar sua produção de estradiol e inibina (figura 12). Mediante um seguimento ultrassonográfico dos ovários é possível identificar pou-cos dias depois um certo número de folículos, que por haver sido recrutados começam um período de crescimento acelerado. Durante alguns dias vários folículos crescem juntos, porém depois um deles é selecionado para continuar crescendo, enquanto que o restante do grupo deixam de fazê-lo e terminam sofrendo atresia. Através da ultrassom é possível identificar o folículo selecionado, agora chamado folículo domi-nante, já que sua trajetória de crescimento sofre um desvio com respeito a seguida pelo restante do grupo. Os folículos que não foram selecionados deixam de crescer e sofrem atresia já que deixam de possuir o suporte gonadotrópico de FSH, uma vez que as concentrações desse hormônio são suprimidos pela inibina e o estradiol produzidos pelo conjunto de folículos que conformam a onda folicular (figura 12), porém o folículo mais desenvolvido do grupo se converterá em dominante. A inibina atua diretamente a nível hipofisário para reduzir a secreção de FSH. Figura 12: onda folicular e relação dos níveis de FSH, estradiol e LH. Fonte: ZARCO, 2018. -/- Figura 13: Recrutamento, seleção e dominação folicular na espécie ovina e influência do FSH e LH nas fases. Fonte: SILVA, E. I. C. da, 2019. -/- A razão pela qual o folículo dominante é capaz de continuar seu desenvolvimento apesar da baixa nas concentrações de FSH é que o folículo é o único que alcançou o grau de progresso necessário para que apareçam os receptores para LH em suas células da granulosa. Esse processo permite ao folículo dominante ser estimulado pela LH, e que requeira baixas concentrações de FSH para manter seu desenvolvimento. A secreção de LH em forma de pulsos de baixa frequência (um pulso a cada quatro a seis horas), característica da fase lútea do ciclo estral; é suficiente para permitir que um folículo dominante continue crescendo por mais dias depois da sua seleção e que mais tarde mantenha-se viável durante alguns dias embora não aumentem de tamanho. Contu-do, se durante o período viável desse folículo não seja finalizada a fase lútea e não diminuam as concentrações de progesterona, o folículo terminará sofrendo atresia devido a exigência de um padrão de secreção acelerada de LH (aproximadamente um pulso por hora) durante o desenvolvimento pré-ovulatório, que somente pode ser produzido com a ausência da progesterona. Uma vez que um folículo dominante sofre atresia deixa de produzir inibina, pelo qual as concentrações de FSH podem elevar-se novamente para iniciar o recrutamento de outro grupo de folículos a partir da qual se origina uma nova onda folicular. Durante o ciclo estral de uma vaca podem gerar-se dois ou três ondas foliculares; somente em raros casos quatro. A etapa de dominância folicular da primeira onda na grande maioria dos casos não coincide com a regressão do corpo lúteo, pelo qual o primei-ro folículo dominante quase invariavelmente termina em atresia. Em algumas vacas o fo-lículo dominante da segunda onda ainda está viável quando se produz a regressão do corpo lúteo e acelera-se a secreção de LH, pelo qual esse segundo folículo dominante se converte em folículo pré-ovulatório e, ao final ovula. Em outros animais o segundo folícu-lo dominante também perde a sua viabilidade antes da regressão do corpo lúteo, por onde nesses animais se inicia uma terceira onda folicular, da qual surge o folículo que finalmen-te ovulará depois de produzir-se a regressão do corpo lúteo. Sem importar a onda em que se origine, uma vez que um folículo dominante é ex-posto a alta frequência de secreção de LH que se produz depois da regressão do corpo lúteo, aumenta ainda mais sua secreção de estradiol até que as altas concentrações desse hormônio comecem a exercer um feedback positivo para a secreção do LH. Isso provoca-rá a aceleração da frequência de secreção do LH até que os pulsos são tão frequentes que começam a ficar por cima e produzir-se o pico pré-ovulatório de LH, que é responsável pela realização da ovulação e a maturação final do ovócito. -/- •___DIFERENÇAS ENTRE ESPERMATOGÊNESE E OVOGÊNESE -/- Enquanto que na fêmea a ovogênese inicia-se durante a vida fetal, no macho a es-permatogênese começa na puberdade. Na fêmea, a partir de um ovócito primário se origi-na um óvulo; no macho, de um espermatócito primário se produzem, teoricamente, quatro espermatozoides. Outra característica interessante é que enquanto a fêmea já conta desde o nasci-mento com todos os ovócitos que necessitará na vida adulta, o macho necessitará chegar a puberdade para iniciar o desenvolvimento das células sexuais, já que ao nascer somente possui gonócitos precursores das células germinais, células de Sertoli e intersticiais. Na vida adulta de uma fêmea, o número de células germinais desaparece paulati-namente. Uma vez iniciada a espermatogênese no macho, a cada ciclo do epitélio seminí-fero as células germinais são renovadas mantendo a provisão para toda a vida reprodutiva. Na fêmea, a meiose sofre duas interrupções em seu transcurso, e no macho é ininterrupta. Figura 14: representação em diagramação comparativa do desenvolvimento da gametogênese. -/- Principais pontos abordados sobre as diferenças entre a gametogênese masculina e feminina: ❙ Na ovogênese a meiose contêm-se em duas ocasiões esperando acontecimentos externos para prosseguir. Já na espermatogênese não existe a suspensão da meiose. ❙ A espermatogênese é um processo contínuo, enquanto que a ovogênese pode completar exclusivamente um óvulo em cada ciclo estral; já que só pode ser completada por mais de um nas espécies que ovulam vários ovócitos no caso das porcas, cadelas, gatas etc. ❙ Na espermatogênese existem células de reserva que permitem a continuação du-rante toda a vida, enquanto que na ovogênese o número de ovócitos primários é limitado. A fêmea somente conta com os que nasceu, e eles não se dividem. ❙ Na espermatogênese obtém-se até 256 espermatozoides para cada espermatogo-nia que inicia o processo, enquanto que na ovogênese somente se obtém um óvulo a partir de cada ovócito primário. ❙ Durante a espermatogênese se produz uma metamorfose que transforma as es-permátides em espermatozoides. Na ovogênese não ocorre um processo análogo. ❙ Na espermatogênese, durante a meiose produzem-se quatro espermátides a partir de cada espermatócito primário. Na ovogênese se produz somente um óvulo a partir de cada ovócito primário; produz, ademais, dois corpos polares. ❙ Todos os óvulos que se produzem durante a ovogênese contém um cromossomo X, enquanto que a metade dos espermatozoides possuem um cromossomo Y e a outra metade um cromossomo X. ❙ Na espermatogênese produzem-se centenas ou dezenas de milhões de esperma-tozoides por dia, enquanto que na ovogênese se produz um ou alguns óvulos a cada ciclo estral. ❙ A espermatogênese produz gametas macroscópicos e com motilidade própria, enquanto que a ovogênese produz gametas grandes e imóveis. -/- REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS -/- ABDEL-RAOUF, Mohammed et al. The postnatal development of the reproductive organs in bullswith special reference to puberty.(Including growth of the hypophysis and the adrenals). Acta endocrinologica, n. Suppl No. 49, 1960. ADONA, Paulo Roberto et al. Ovogênese e foliculogênese em mamíferos. Journal of Health Sciences, v. 15, n. 3, 2013. AERTS, J. M. J.; BOLS, P. E. 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Well prior to the invention of the term ‘biology’ in the early 1800s by Lamarck and Treviranus, and also prior to the appearance of terms such as ‘organism’ under the pen of Leibniz in the early 1700s, the question of ‘Life’, that is, the status of living organisms within the broader physico-mechanical universe, agitated different corners of the European intellectual scene. From modern Epicureanism to medical Newtonianism, from Stahlian animism to the discourse on the ‘animal economy’ in vitalist medicine, models (...) of living being were constructed in opposition to ‘merely anatomical’, structural, mechanical models. It is therefore curious to turn to the ‘passion play’ of the Scientific Revolution – whether in its early, canonical definitions or its more recent, hybridized, reconstructed and expanded versions: from Koyré to Biagioli, from Merton to Shapin – and find there a conspicuous absence of worry over what status to grant living beings in a newly physicalized universe. Neither Harvey, nor Boyle, nor Locke (to name some likely candidates, the latter having studied with Willis and collaborated with Sydenham) ever ask what makes organisms unique, or conversely, what does not. In this paper I seek to establish how ‘Life’ became a source of contention in early modern thought, and how the Scientific Revolution missed the controversy. (shrink)

We introduce the Vital Sign Ontology (VSO), an extension of the Ontology for General Medical Science (OGMS) that covers the consensus human vital signs: blood pressure, body temperature, respiratory rate, and pulse rate. VSO provides a controlled structured vocabulary for describing vital sign measurement data, the processes of measuring vital signs, and the anatomical entities participating in such measurements. VSO is implemented in OWL-DL and follows OBO Foundry guidelines and best practices. If properly developed and extended, we believe the VSO (...) will find applications for the EMR, clinical informatics, and medical device communities. (shrink)

Cross-linguistic strategies for mapping lexical and spatial relations from body partonym systems to external object meronymies (as in English ‘table leg’, ‘mountain face’) have attracted substantial research and debate over the past three decades. Due to the systematic mappings, lexical productivity and geometric complexities of body-based meronymies found in many Mesoamerican languages, the region has become focal for these discussions, prominently including contrastive accounts of the phenomenon in Zapotec and Tzeltal, leading researchers to question whether such systems should be explained (...) as global metaphorical mappings from bodily source to target holonym or as vector mappings of shape and axis generated “algorithmically”. I propose a synthesis of these accounts in this paper by drawing on the species-specific cognitive affordances of human upright posture grounded in the reorganization of the anatomical planes, with a special emphasis on antisymmetrical relations that emerge between arm-leg and face-groin antinomies cross-culturally. Whereas Levinson argues that the internal geometry of objects “stripped of their bodily associations” (1994: 821) is sufficient to account for Tzeltal meronymy, making metaphorical explanations entirely unnecessary, I propose a more powerful, elegant explanation of Tzeltal meronymic mapping that affirms both the geometric-analytic and the global-metaphorical nature of Tzeltal meaning construal. I do this by demonstrating that the “algorithm” in question arises from the phenomenology of movement and correlative body memories—an experiential ground which generates a culturally selected pair of inverse contrastive paradigm sets with marked and unmarked membership emerging antithetically relative to the transverse anatomical plane. These relations are then selected diagrammatically for the classification of object orientations according to systematic geometric iconicities. Results not only serve to clarify the case in question but also point to the relatively untapped potential that upright posture holds for theorizing the emergence of human cognition, highlighting in the process the nature, origins and theoretical validity of markedness and double scope conceptual integration. (shrink)

The electric activities of cortical pyramidal neurons are supported by structurally stable, morphologically complex axo-dendritic trees. Anatomical differences between axons and dendrites in regard to their length or caliber reflect the underlying functional specializations, for input or output of neural information, respectively. For a proper assessment of the computational capacity of pyramidal neurons, we have analyzed an extensive dataset of three-dimensional digital reconstructions from the NeuroMorphoOrg database, and quantified basic dendritic or axonal morphometric measures in different regions and layers of (...) the mouse, rat or human cerebral cortex. Physical estimates of the total number and type of ions involved in neuronal electric spiking based on the obtained morphometric data, combined with energetics of neurotransmitter release and signaling fueled by glucose consumed by the active brain, support highly efficient cerebral computation performed at the thermodynamically allowed Landauer limit for implementation of irreversible logical operations. Individual proton tunneling events in voltage-sensing S4 protein alpha-helices of Na+, K+ or Ca2+ ion channels are ideally suited to serve as single Landauer elementary logical operations that are then amplified by selective ionic currents traversing the open channel pores. This miniaturization of computational gating allows the execution of over 1.2 zetta logical operations per second in the human cerebral cortex without combusting the brain by the released heat. (shrink)

This paper aims to deal with the disputes on transferring demonstration between the various sciences in the context of the medicine-geometry relationship. According to Aristotle’s metabasis-prohibition, these two sciences should be located in separate compartments due to the characteristics of their subject-matter. However, a thorough analysis of the critical passage in Aristotle’s Posterior Analytics on circular wounds forces a revision of the boundaries of the interactions between sciences, since subsequently Avicenna, on the grounds of this passage, would widen the area (...) of the transference of demonstration. Furthermore, the fact that Avicenna and Ibn al-Nafīs continued to use geometrical demonstrations in their anatomical investigations shows the need to understand kind-crossing prohibition as a reminder to take into account the present scientific infrastructure and logical rules before proceeding onto a scientific investigation instead of accepting it as a mere nominal doctrine. Therefore, whether kind-crossing was possible or not depended on the extent to which the conclusion derived at the end of the scientific investigation, using a different method after taking into account all these reminders, had contributed to the solution of a particular proposition or the achievement of an approximate truth. (shrink)

The pivotal role of the relation part-of in the description of living organisms is widely acknowledged. Organisms are open systems, which means that in contradistinction to mechanical artifacts they are characterized by a continuous flow and exchange of matter. A closer analysis of the spatial relations in biological organisms reveals that the decision as to whether a given particular is part-of a second particular or whether it is only contained-in the second particular is often controversial. We here propose a rule-based (...) approach which allows us to decide on the basis of well-defined criteria which of the two relations holds between two anatomical objects, given that one spatially includes the other. We discuss the advantages and limitations of this approach, using concrete examples from human anatomy. (shrink)

Evolutionary linguistics is methodologically inspired by evolutionary psychology and the neo-Darwinian, selectionist approach. Language is claimed to have evolved by means of natural selection. The focus therefore lies not on how language evolved, but on finding out why language evolved. This latter question is answered by identifying the functional benefits and adaptive status that language provides, from which in turn selective pressures are deduced. This article analyses five of the most commonly given pressures or reasons why presumably language evolved. I (...) demonstrate that these reasons depend on functional definitions of what language is. To undo this bias, I suggest that scholars move away from the ?why? and ?what for? questions of language evolution, and focus on how language actually evolved. The latter project inquires into the distinct evolutionary mechanisms enabling the evolution of the anatomical and sociocultural traits underlying linguistic behaviour. (shrink)

Locke and Leibniz deny that there are any such beings as ‘monsters’ (anomalies, natural curiosities, wonders, and marvels), for two very different reasons. For Locke, monsters are not ‘natural kinds’: the word ‘monster’ does not individuate any specific class of beings ‘out there’ in the natural world. Monsters depend on our subjective viewpoint. For Leibniz, there are no monsters because we are all parts of the Great Chain of Being. Everything that happens, happens for a reason, including a monstrous birth. (...) But what about materialism? Well, beginning with the anatomical interest into ‘monstrous births’ in the French Académie des Sciences in the first three decades of the eighteenth century, there is a shift away from ‘imaginationist’ claims such as those of Malebranche, that if a woman gives birth to a monstrous child it is a consequence of something she imagined. Anatomists such as Lemery and Winslow try to formulate a strictly mechanical explanation for such events, rejecting moral and metaphysical explanations. Picking up on this work, materialist thinkers like Diderot are compelled to reject the very idea of monsters. We are all material beings produced according to the same mechanisms or laws, some of us are more ‘successful’ products than others, i.e. some live longer than others. In his late Eléments de physiologie he says “L’homme est un effet commun, le monstre un effet rare.” Ultimately he arrives at a materialist version of Leibniz’s position: there are no monsters, we are all monsters in each other’s eyes, at one time or another. This conclusion is a pregnant one in light of twentieth century interest in the problem of ‘the normal and the pathological’ (Canguilhem), and the broader question of how materialism relates to the biological world. (shrink)

Objective: We aimed to investigate the image quality of paranasal sinus computed tomography (CT) scans obtained with the “Advanced intelligent Clear-IQ Engine” (AICE) software and ultra-low dose parameters in patients with prediagnosed rhinitis, sinusitis or nasal septum deviation. -/- Methods: The first 50 patients (31 men and 19 women, aged 18-70 years) who agreed to participate in our prospectively planned study were included in the study. Imaging of the patients was performed with a 160-slice multidetector CT device Canon Aquilion Prime (...) SP (Canon Medical Systems, Otawara, Japan). Tube voltage of 80 kV and tube current of 40 mA were chosen. The effective radiation dose (ED) was calculated based on the “dose-length product” (DLP) information of each patient. Evaluation of images was made on reformat images made with “AiCE Bone” filter in the axial and coronal planes. All images were double-blindly evaluated by 2 radiologists out of 5 points (5 = very good; 1 = not diagnostic). The visibility of 17 bilateral important anatomical landmarks examined on paranasal sinus CT was scored (0 = not visible; 2 = completely visible). In the evaluation of images, the agreement between radiologists was evaluated with Kappa statistics. -/- Results: The median ED value of the CT protocol was 0.015±0.001 mSv [range 0.012-0.017 mSv]. The overall image quality of the images in our study was interpreted as 4 (good) or 3 (moderate) for all patients. Inter-research agreement was 92%. Most of the anatomical landmarks evaluated were completely visible. Six (bilateral of three) anatomical landmarks could be partially visible in some patients. -/- Conclusion: Combining the ultra-low dose CT protocol and the AiCE reconstruction algorithm makes it possible to achieve very low ED values ​​in paranasal sinus CT scans and still obtain sufficient image quality in indications such as septum deviation and sinusitis. (shrink)

Introduction: The objective of this investigation is to analyse the informational circuits of the brain connections with the body from neurologic and neuroscience point of view, on the basis of the concepts of information promoted by the Informational Model of Consciousness. Analysis: Distinguishing between the virtual and matter-related information promoted by the Informational Model of Consciousness, the main specific features of consciousness are analyzed from the informational perspective, showing that the informational architecture of consciousness consists in seven groups of specific (...) activities, defined as cognitive centres, each of them with specific distinct tasks, but correlated each other: centre of acquisition and storing of information (memory), centre of decision and command (decision), centre of the emotional states (emotions), centre of the body maintenance (power and health), centre of the genetic elaboration/transmission (reproduction) and the info-genetic generator, inherited from the parents (predispositions, talents and skills). A special centre, dedicated to the connectivity with some extra-power properties of the mind is also introduced, assuring an intimate supra-sensitive detection of the world to explain the associated phenomena of the near-death experiences. Result: The activity of all these centres should be supported neurologically by the brain neuro-connectivity to the body and to external and internal info-signals. On the basis of the informational analysis, the neuro-connections of the brain regions associated to the main characteristics of the cognitive centres are highlighted, showing the anatomic and neuro-functional relation between the distinct components of the brain and the specific operating body regions. These connections describe in terms of information the brain-body neuro-activities as informational specific circuits, composed by the info-operational subsystems managed by the brain, and sensors, transducer and execution elements. Conclusion: The components and connections mind-body stipulated by the Informational Model of Consciousness are supported by the neurologic/neuroscience evidence. (shrink)

The Plant Ontology (PO) (http://www.plantontology.org) (Jaiswal et al., 2005; Avraham et al., 2008) was designed to facilitate cross-database querying and to foster consistent use of plant-specific terminology in annotation. As new data are generated from the ever-expanding list of plant genome projects, the need for a consistent, cross-taxon vocabulary has grown. To meet this need, the PO is being expanded to represent all plants. This is the first ontology designed to encompass anatomical structures as well as growth and developmental stages (...) across such a broad taxonomic range. While other ontologies such as the Gene Ontology (GO) (The Gene Ontology Consortium, 2010) or Cell Type Ontology (CL) (Bard et al., 2005) cover all living organisms, they are confined to structures at the cellular level and below. The diversity of growth forms and life histories within plants presents a challenge, but also provides unique opportunities to study developmental and evolutionary homology across organisms. (shrink)